Virobiota


INTRODUCCION

El cuerpo humano está colonizado por microorganismos comensales que abarcan diversos philos a partir de los tres dominios de la vida: Eukarya, Archaea y Bacteria. La mayoría de estos microorganismos residen en las superficies del cuerpo que están en contacto directo con el medio ambiente, incluyendo el intestino, la piel y el tracto respiratorio. Los esfuerzos deinvestigación en los últimos dos decenios se han centrado principalmente en el componente bacteriano de la microbiota humana y sus genes asociados (el "microbioma"). Estos esfuerzos han producido una gran cantidad de conocimiento sobre la composición de las comunidades bacterianas-humanas, como estas bacterias residentes interactúan con el sistema inmunológico y cómo las interacciones bacterias-sistema sealteran en la enfermedad
Recientemente, se ha hecho evidente que la microbiota de los seres humanos sanos también incluye virus, denominada la "virobiota'. Gran parte de nuestro conocimiento actual de la virobiota se deriva de la metagenómica, estudios en los que el ADN (y, a veces ARN) contiene la secuencia de una comunidad microbiana. Estos estudios han revelado que el microbioma humano incluyemuchos genes virales (la 'viroma'). El intestino y la piel, por ejemplo, están tan asociado con virus que se replican en las células eucariotas (virus eucariotas), y virus que se replican en bacterias (bacteriófagos o fagos). La microbiota intestinal también contiene los virus que infectan a las plantas, lo que probablemente está asociado con la dieta del anfitrión.
Las bacterias que habitan enel intestino y la piel son generalmente considerados como residentes estables que confieren beneficios metabólica y / o inmunes a su hospedero. Por lo tanto, es razonable preguntarse si los virus también pueden estar asociados de forma estable con los tejidos humanos sanos. En el caso de los bacteriófagos, una asociación persistente, no patógena parece posible, ya que la replicación viral queocurre en huéspedes bacterianos, que pueden ser ellos mismos miembros estables de la microbiota.
Por el contrario, la relación de los virus eucariotas para sus huéspedes humanos es mucho menos clara. Tales virus requieren células huéspedes para replicarse y en la mayoría de los casos provocan respuesta inmune innata y / o adaptativa después de la entrada en las células huésped. Por lo tanto, losvirus de eucariotas muestreados en estudios de metagenómica podrían incluir los de infecciones agudas, aguda recurrente o infecciones crónicas o los recién surgidos virus latentes. En ausencia de estudios metagenómicos longitudinal detallados de la virobiota, es difícil saber en este momento si la virobiota eucariota humana incluye virus verdaderamente residentes que están asociados de forma establecon los tejidos del huésped sano.
En esta perspectiva vamos a discutir cómo la virobiota interactúa con el sistema inmune y cómo esto podría afectar la salud del huésped. Nos vamos a centrar la mayor parte de nuestro debate sobre los virus asociados con los tejidos que están en relación con el ambiente externo (por ejemplo, intestino, la piel y las vías respiratorias). Es importante reconocerque el estudio de la virobiota es un campo emergente y nuestra comprensión de cómo estos virus interactúan con el sistema inmunológico actualmente es mínimo. Así, algunas de nuestras discusiones serán especulativas por la necesidad.
Sin embargo, nuestro objetivo es proporcionar un marco para pensar sobre las interacciones del sistema inmunológico-virobiota en huéspedes mamíferos y para motivar alos estudios experimentales de estas interacciones.

Los bacteriófagos que se asocian con los tejidos del huésped
Estudios Metagenomicos de la microbiota en varios sitios de tejido han revelado que muchos de los virus asociados con los tejidos humanos sanos son bacteriofagos. La secuenciación de la metagenomica a partir de material fecal humana ha revelado que muchos fagos asociado con la...