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base de datos biológica orientada a la automatización del proceso de construcción de modelos a escala genómica. RESULTADOS EN LA Synechocystis. sp PCC6803
biological databases oriented automation process of building genomic scale models. results in the synechocystis. sp pcc6803
MSc. Raymari Reyes Chirino1, MSc. Ramón A. Jaime Infante2, MSc. Jorge Garrido González3, Lic. Julián Triana Dopico4,Lic. Lizzael Villar5, MSc. Vinelia Córdova Vazquez6, Dr. Juan C. Castro Palacios7, Dr. Emilio Navarro8, MSc. Arnau Montagud 9, Dr. Pedro Fernández de Córdoba10, Dr. Javier F. Urchueguía11, Dr. Julio Martínez Prieto12

1 Universidad de Pinar del Río, Cuba, raymari@info.upr.edu.cu, Carretera Central Edif 7, apto 8-C, Rpto 10 de octubre, Pinar del Río, CP 20200
2, 3, 5, 6 Universidad de Pinardel Río, Cuba; ramon,jgarrido,lizzael,vinelia@info.upr.edu.cu
4 Universidad de Pinar del Río, Cuba, jtriana@avrect.upr.edu.cu
7 Universidad de Pinar del Río, Cuba, juanc@geo.upr.edu.cu
8, 9, 10, 11 Universidad Politécnica de Valencia, Valencia, España, pfernandez,armontag@mat.upv.es;
enavarro,jfurchueguia@fis.upv.es
12 Instituto Superior Politécnico José A. Echeverría, Cuba,jmp@ceis.cujae.edu.cu


Resumen
La presente investigación forma parte del intercambio científico y la colaboración entre el Grupo Interdisciplinario de modelación, InterTech (www.intertech.upv.es), vinculada al Instituto Universitario de Matemática Pura y Aplicada de la Universidad Politécnica de Valencia, España y el Grupo Interdisciplinario de modelado, InterTech de la Universidad de Pinar del Río, Cuba.Con el desarrollo de la Biología Sintética, se observa una nueva generación de bioingenieros que desarrollan complejos circuitos biológicos genéticos con un alto nivel de integración. En este contexto, se está desarrollando un sistema de gestión y un acceso eficaz a diferentes bases de datos de información biológica (a diferentes niveles: la proteómica, la genómica, la transcriptómica, etc.) Otrarazón para este proyecto es que, aunque hay diferentes programas (por ejemplo, Pathway Tools ) capaces de acceder a esas bases de datos y programas que incorporan ciertos mecanismos de depuración y la filtrado de información, aún se requiere de un gran esfuerzo en el desarrollo de estos mecanismos que permiten la manipulación posterior para la gestión de la información biológica. Como prueba deconcepto, el sistema es utilizado como base para el desarrollo del modelo metabólico eficaz del metabolismo central de Synechocystis. sp PCC6803.

Palabras Clave:
Base de datos, Biología Sintética, Kegg, Modelos de datos, Modelo metabólico, Servicios Web.

Abstract
This research is part of scientific exchange and collaboration between the Interdisciplinary Modeling Group, InterTech(www.intertech.upv.es), vinculated to the Institute of Pure and Applied Mathematics from the Polytechnic University of Valencia, Spain and the Interdisciplinary Modeling Group, InterTech, University of Pinar del Rio, Cuba. The SB is centered in the design and the construction of artificial genetic systems, capable of developing a specific function after being introduced or inserted inserted into a livingsystem. With the development of SB, there is emerging a new generation of bioengineers who develop complex biological genetic circuits with a high level of integration. In this context we are developing a management system and efficient access to various databases of biological information (at different levels: proteomics, genomics, transcriptomics, etc..) Reason to take this project is that,although there are different programs ( Pathways Tools eg) able to access those databases and such programs incorporate certain mechanisms of puration and filtration of information, it still requires a great effort in the development of these mechanisms to allow subsequent efficient manipulation of biological information. As proof of concept, the system is used as the basis for the development of...