Aminiacidos

Aminoácidos

La estructura general de los aminoácidos es esta que tienen aquí, con la excepción de la prolina ya que no se cumple.

Tiene un grupo amino, con un grupo carboxílico unido a un carbono central que tiene un átomo de hidrogeno y una cadena lateral R.
La cadena lateral es la que le da la identidad al aminoácido.


Lo que vemos acá es cómo se le denomina a los carbonos a partirdel grupo carboxílico.
Al carbono ALFA se le denomina así porque esta unido al grupo carboxílico y al grupo amino y a la cadena lateral. Por lo tanto llamamos ALFA aminoácidos cuando hablamos de aminoácidos.







Lo que vemos acá es la alanina: ¿una configuración o conformación distinta?... Una configuración distinta a cada lado, la cadena lateral es la que se ve acá (en rojo),y el carbono ALFA en el centro para ver la configuración en este caso. Hay algún otro carbono que tenga 4 sustituyentes diferentes? No, no tienen que dudarlo. Hablamos de configuración diferente porque no puedes pasar de la izquierda a la derecha el grupo amino, tendríamos que romper un enlace covalente, por lo tanto es una configuración distinta.
La D y L habla del lugar donde esta el grupoamino.
D cuando esta en la derecha y L cuando esta a la izquierda.
Fíjense que hay una relación entre la configuración de la alanina y el gliceraldehido. Qué es un glicerol? Primero un grupo aldehído y luego un grupo alcohol, pero este seria un carbono asimétrico ya que tendría lo mismo arriba y abajo en el caso del glicerol. Entonces tenemos que compararlo con el gliceraldehido como molécula básicapara ver la configuración, y se relaciona el L-gliceraldehido con la L-alanina por su comparación en el OH y el OH del L- gliceraldehido esta al mismo lado que el grupo amino en la L-alanina.
Se puede tener como referencia el L-gliceraldehido para establecer la configuración de la L-alanina en cuanto a la configuración.
El grupo amino y hay que decir ALFA amino, porque está unido al carbonoALFA esta a la izquierda.

Esta tabla es muy importante porque nos muestra los 20 aminoácidos estándares que conforman la proteína y hay otros aminoácidos no estándares, y por qué se llaman estándares? Porque pertenecen al grupo de los 20 aminoácidos y hay otro que quedan afuera y esos son los no estándares. Y habrá aminoácidos que no constituyen proteínas? Sí, hay algunos que conformanproteínas y otros que no.
Acá vemos los 20 estándares y aprovecho de recordarles que tienen que aprendérselos de memoria los nombres abreviados y el de una letra, ya que siempre es bueno saberlo, por ultimo para ejercitar el músculo de la memoria, eso les dará más fluidez al leer.


(da ejemplos para aprendérselos mas fácil con unas tarjetitas para ejercitar los viernes en la noche cuac!)

Lo queaparece acá (Mr) es peso molecular, la constante de acidez del grupo ALFA carboxilo, la constante de acidez del grupo amino y la constate de acidez de otro grupo que es deprotonable, que cuando lo tenga no todos tienen que tener grupos deprotonables, por ejemplo acá tenemos 10.07 de la tirosina y la verdad es que es bien poco deprotonable la cadena lateral de la tirosina.
En este otro casotenemos el aspartato que parece nombrado como si fuese un acido carboxílico deprotonado con su base conjugada por lo tanto y puede ser nombrado como acido aspartatico y aparece con 3,65 para su cadena lateral.
Si ustedes tienen dos grupos deprotonables y hay dos constantes de acidez, digamos grupo 1 K1 y grupo 2 K2. Si K1 es mayor que K2 cual pierde el protón con mas facilidad? K1 pierde el protóncon mas facilidad que k2 (no más rápido sino que con mas facilidad).
Que lo pierda con mayor facilidad no significa que lo tenga el otro grupo como que lo suelta pero no lo suelta, si no que el grupo de mayor K predomina mas las especies acidas que las bases conjugadas. Es mas predominable las sustancias acidas de K1. el grupo 2 es menos deprotonable que el grupo 1.
Si entienden eso… ahora:...