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Biosíntesis de proteínas. Es uno de los procesos de síntesis celular que requiere de un gran número de componentes, siendo muchos más de 100. Para poder estudiar el mecanismo, éste se divide en tres etapas: iniciación, elongación y término. Un concepto importante es el flujo de información, donde el DNA almacena información en los genes los que se transcriben en RNA y en especial interesan losmRNA que son los que se traducen a una proteína. Entonces desde la información contenida en el DNA llegamos a la estructura de una proteína que es la que desarrolla las funciones en la célula. Cuando se comenzó a estudiar la traducción la pregunta era: ¿cómo era posible que la célula obtuviera información de moléculas mRNA, un mensaje que está codificado por nucléotidos, y la tradujera a un lenguajede aa para traducirla en una proteína? Crick propuso la existencia de una molécula llamada el adaptador que era capaz de reconocer el lenguaje de nucleótidos y además podía leer el lenguaje de aa, siendo una especie de molécula bilingüe, y que había que centrarse en la búsqueda de ella para entender cómo se producía la transmisión de un lenguaje a otro. La molécula adaptadora resultó ser el tRNA.El tRNA es una molécula lineal que adopta una estructura secundaria con forma de trébol, donde una cadena va en dirección 5’-3’ y se une a otra cadena antiparalela en dirección 3’-5’, siendo la interacción entre las bases por medio de puentes de hidrógeno. El extremo 5’ siempre se escribe al lado izquierdo. Este extremo está formando estructura secundaria con la región correspondiente al extremo3’ de la molécula. Esta estructura secundaria que se forma entre el 5’ y el 3’ de la molécula, constituye lo que se llama el brazo del aa o brazo aceptor. Se llama así porque al extremo 3’ de esta zona se une el aa. Al avanzar por el extremo 5’ la molécula vuelve a adoptar una estructura secundaria y se forma un bucle (que no es lo mismo que una horquilla). En la gran mayoría de los tRNA, en elprimer bucle, hay dos o tres bases que se llaman dihidrouridina. Como estas moléculas se concentran en esta región del tRNA, esto se conoce como el brazo de la dihidrouridina. Si seguimos avanzando hacia el brazo 3’ nos encontramos con otra estructura de bucle formada por apareamiento intracatenario. Esta parte de la molécula corresponde al brazo del anticodón. Al lado derecho de la molécula apareceotra estructura de bucle, formada también por apareamiento intracatenario que le da una estructura secundaria. Esta porción es el brazo TψC (timina-pseudouridina-citosina).Algunos tRNA tienen un brazo extra que resulta de tamaño variable. Por ejemplo, el tRNA de fenilalanina tiene una estructura bastante larga que es como una horquilla. Entonces este brazo extra es una horquilla, no es un bucle.En el extremo 3’ todos los tRNA terminan en la secuencia CCA, de tal manera que la última base del tRNA es una adenina. Este es el extremo CCA. En el caso de las bacterias, esta estructura CCA está codificada en el DNA. En el caso de las células eucariontes, la estructura CCA es incorporada enzimáticamente. En esta organización de RNA aparecen bases como la dihidrouridina, como la pseudouridina yademás en uno de los brazos existe una timina. ¿Es natural que esto ocurra en la estructura de un RNA que se transcribe desde el DNA? ¿Están codificadas en el DNA las dihidrouridinas o las pseudouridinas? En la síntesis del mRNA eucarionte hay procesamiento, hay una etapa de maduración, por lo tanto, lo que se sintetiza es una molécula precursora. En el caso de todos los tRNA en bacterias y eneucariontes, pasa lo mismo, las moléculas se sintetizan como moléculas precursoras y ellas tienen uridina originalmente en las posiciones donde luego encontramos timina, dihidrouridina y pseudouridina. Los tRNA se sintetizan como moléculas precursoras y en muchas de ellas hay fragmentos de tRNA que son eliminados durante el procesamiento y eso se asimila a un splicing. Además, enzimáticamente...