cryptococcus
Páginas: 2 (266 palabras)
Publicado: 16 de agosto de 2014
Genoma de Cryptococcus
Cryptococcus neoformans (Varios serotipos: A,B,D)
Cryptococcus neoformans es una levadura basidiomycetous ubicuo en el medio ambiente, un patógeno humano oportunista deimportancia mundial. Hemos secuenciado su genoma ~ 20-megabase, que contiene ~6500 intrón rica en estructuras de genes y codifica una transcriptoma abundante en mensajes empalmados alternativamente yantisentido. El genoma es rico en transposones, muchas de las cuales se agrupan en regiones centroméricas candidatos. La presencia de estos transposones puede conducir inestabilidad cariotipo y lavariación fenotípica. C. neoformans codifica genes únicos que pueden contribuir a sus propiedades de virulencia inusuales, y la comparación de dos cepas fenotípicamente distintas revela variación enel contenido de genes, además de la secuencia polimorfismos entre los genomas3
14 cromosomas de 762 kb a 2,3 Mb
Por ejemplo del serotipo D (JEC 20/JEC21)
(NCBI)
Abundantes intrones,aproximadamente 6 500 (Eidi Alvarado Ramírez, 2008)
Casi 5% del genoma consta de transposones, la mayoría agrupado en cada cromosoma en bloques individuales que se extienden de 40 a 100 kb que puedenrepresentar centrómeros regionales independiente de la secuencia.3
Se identificaron un total de 6.572 genes que codifican proteínas, que contienen un promedio de 6.3 exones de 255 pares de bases (pb) y5,3 intrones de 67 pb 3
Referencias
1) Eidi Alvarado Ramírez. (2008). Estudio de los factores de patogenicidad de Cryptococcus gatti. Barcelona. Obtenido dehttp://www.tdx.cat/bitstream/handle/10803/3921/evr1de1.pdf;jsessionid=2B0401AC7A02BB29D2881CA7CB8515DA.tdx2?sequence=1
2) NCBI. (s.f.). Obtenido de http://www.ncbi.nlm.nih.gov/assembly/GCF_000091045.1
3) Brendan J.Loftus, Eula Fung, Paola Roncaglia, Don Rowley, Paolo Amedeo, Dan Bruno. The Genome of the Basidiomycetous Yeast and Human Pathogen Cryptococcus neoformans. Science.2005;307(2):1321-1324
Cryptococcus neoformans (Varios serotipos: A,B,D)
Cryptococcus neoformans es una levadura basidiomycetous ubicuo en el medio ambiente, un patógeno humano oportunista deimportancia mundial. Hemos secuenciado su genoma ~ 20-megabase, que contiene ~6500 intrón rica en estructuras de genes y codifica una transcriptoma abundante en mensajes empalmados alternativamente yantisentido. El genoma es rico en transposones, muchas de las cuales se agrupan en regiones centroméricas candidatos. La presencia de estos transposones puede conducir inestabilidad cariotipo y lavariación fenotípica. C. neoformans codifica genes únicos que pueden contribuir a sus propiedades de virulencia inusuales, y la comparación de dos cepas fenotípicamente distintas revela variación enel contenido de genes, además de la secuencia polimorfismos entre los genomas3
14 cromosomas de 762 kb a 2,3 Mb
Por ejemplo del serotipo D (JEC 20/JEC21)
(NCBI)
Abundantes intrones,aproximadamente 6 500 (Eidi Alvarado Ramírez, 2008)
Casi 5% del genoma consta de transposones, la mayoría agrupado en cada cromosoma en bloques individuales que se extienden de 40 a 100 kb que puedenrepresentar centrómeros regionales independiente de la secuencia.3
Se identificaron un total de 6.572 genes que codifican proteínas, que contienen un promedio de 6.3 exones de 255 pares de bases (pb) y5,3 intrones de 67 pb 3
Referencias
1) Eidi Alvarado Ramírez. (2008). Estudio de los factores de patogenicidad de Cryptococcus gatti. Barcelona. Obtenido dehttp://www.tdx.cat/bitstream/handle/10803/3921/evr1de1.pdf;jsessionid=2B0401AC7A02BB29D2881CA7CB8515DA.tdx2?sequence=1
2) NCBI. (s.f.). Obtenido de http://www.ncbi.nlm.nih.gov/assembly/GCF_000091045.1
3) Brendan J.Loftus, Eula Fung, Paola Roncaglia, Don Rowley, Paolo Amedeo, Dan Bruno. The Genome of the Basidiomycetous Yeast and Human Pathogen Cryptococcus neoformans. Science.2005;307(2):1321-1324
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