Proteomica

4. Proteómica, poderosa pero poco explorada ómica en la búsqueda y desarrollo de nuevos fármacos
LAUREANO SIMÓN BUELA y ANTONIO MARTÍNEZ MARTÍNEZ

RESUMEN La Proteómica es una disciplina comparativa que pretende identificar y caracterizar aquellas proteínas que diferencian, a nivel de expresión o de modificación química o estructural, la célula o el tejido enfermo del sano. Esas proteínasdiferenciales serán los marcadores con los que desarrollar métodos de predicción, diagnóstico, pronóstico o respuesta a fármacos de la enfermedad en estudio; esas proteínas diferenciales también podrán ser candidatas a dianas terapéuticas contra las que desarrollar nuevas generaciones de fármacos con los que tratar la enfermedad de una manera más eficaz y menos tóxica para el individuo. Pese a todassus limitaciones técnicas, la Proteómica permite la identificación de nuevas dianas terapéuticas contra las que dirigir nuevas generaciones de fármacos; la optimización no invasiva de los ensayos clínicos de esos fármacos, seleccionando aquellos pacientes con una mayor probabilidad de responder mejor al fármaco y ajustando, idealmente de una manera personalizada, las dosis de administración; y laoptimización no invasiva del tratamiento con el fármaco de pacientes crónicos que lo necesiten, a través de la monitorización de marcadores de respuesta en períodos largos de tiempo. 1. GENÓMICA Y PROTEÓMICA El conocimiento de la secuencia completa del genoma humano ha sido un gran avance de la Ciencia y de la Humanidad para la que todos los científicos

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LAUREANO SIMÓN BUELA Y ANTONIOMARTÍNEZ MARTÍNEZ

trabajamos, o deberíamos trabajar, pero no es la panacea que se ha presentado como la solución a todas las complicaciones fisiológicas que comprometen el deseado estado de buena salud. Dentro de unos años las generaciones futuras de brillantes cerebros a los que tendremos que ilusionar y atraer al mundo científico, podrán confirmar la sabiduría popular clásica que no duda encalificar a la ignorancia como siempre osada. Creemos que tenemos la solución a nuestros problemas en nuestras cabezas y bases de datos, pero desconocemos el significado de la mayor parte de ese conocimiento, la secuencia del genoma humano; y en nuestra ignorancia, como no sabemos qué sentido tiene la existencia de enormes regiones de esa secuencia completa, la despreciamos denominándola DNA basura, ycentramos nuestros esfuerzos en esas regiones más pequeñas y discretas, que codifican las proteínas responsables de la ejecución de la estructura y las funciones del cuerpo humano (1, 2); sin reparar en muchas ocasiones en que esas proteínas posiblemente no sean más que obreras dirigidas por entramados moleculares mucho más complejos de interacciones proteína-proteína, proteína-DNA, proteína-RNA,DNA-DNA, RNA-RNA, ......, interacciones en las que esa basura de DNA, que nos estorba en nuestra simplicidad, posiblemente juegue un papel básico y determinante (3, 4). Pero, dejémosles a las futuras generaciones algo con lo que trabajar y apasionarse, y limítenos a lo más obvio, lo más tangible, lo más fácilmente asimilable por nuestros cerebros y por los cerebros de nuestros colegas que evaluaránla calidad científica de nuestros trabajos y de nuestras solicitudes de financiación. Y si simplicidad es lo que buscamos, nada mejor que el universo bidimensional del DNA codificante y su RNA transcrito, sólo incordiado por intrones estructurales y enojosos procesos de splicing alternativo; cierto es que incluso podemos dedicar una carrera entera, por no decir institutos enteros, a disfrutar conla búsqueda de nuevas mutaciones, variaciones alélicas, aberraciones cromosómicas, incluso enrevesadas metilaciones del DNA, o complejos mecanismos de regulación transcripcional, en cis o en trans, de modificaciones postranscripcionales, de degradación del RNA, hasta podemos estudiar la razón de ser de las ribozimas. Y si queremos ser todavía más prácticos y aplicados, nos zambulliremos en el...