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 Porque no acertó en lo esencial. Si lo piensas, Darwin tenía aproximadamente el mismo conocimiento biológico que Lamarck, pero se basó en otros principios. Para Lamarck la función hace al órgano y por tanto el uso o desuso de un cierto órgano en una especie hace que esta se pierda o se potencie. El se basaba en la idea muy extendida por entonces en la ciencia en general y en otras disciplinasde que los seres vivos buscan la perfección y esto cuadraba con la idea de Lamarck. Desde nuestra perspectiva actual la Genética nos dice claramente que solo se transmiten aquellas características que se encuentran en el ADN de las células germinales o gametos. Tanto Lamark como Darwin obviaron esta realidad porque no se había desarrollado aún la citología ni los principios de Genética máselementales. Sin embargo, Darwin pone el peso de la evolución en la diversidad de los organismo en cuanto a su descendencia (intuición de la variabilidad aportada por la meiosis y las mutaciones, sin llamarlo así) y en la Selección Natural, una serie de circustancias ambientales que elegía dentro de esa diversidad. Para Lamarck(un hombre más cercano a la Iustración), era el propio individuo el que se"forzaba" por evolucionar 
Te cuento esta historia de esta forma porque aunque Lamarck no acertara no se le puede quitar el mérito de ser un adelantado a su tiempo,puesto que en un mundo que proponía un inmovilismo estricto de las especies animales y vegetales él encontró una alternativa. No fue nada fácil. Pero así es como funciona la ciencia, sino que se lo pregunten a Bohr o a Wegener
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Hay 3tipos de adaptación al medio:
Morfológica o estructural:Estas adaptaciones pueden ser anatómicas, pero dentro de las adaptaciones morfológicas también se incluye el mimetismo y la coloración críptica. Por ejemplo, entre las adaptaciones de los cactus al ambientedesértico se encuentran las espinas que son hojas modificadas. Las espinas protegen a los tejidos suculentos del cactus depotenciales herbívoros, sirven como lugares de condensación de la humedad del aire y como protección de la corteza fotosintética contra la insolación intensa y la radiación UV.6 Además, el color de las espinas (a menudo tienen el color del pasto seco) podría ser una adaptación para el camuflaje o para el reconocimiento por parte de lospolinizadores o de los dispersantes de las semillas.7
Fisiológica o funcional: Porejemplo, la glándula de la sal en las iguanas marinas de las islas Galápagos es una adaptación que permite a las iguanas, cuyos riñones son incapaces de producir una orina concentrada, excretar el exceso de sal incorporado al tragar agua de mar o a través de la superficie del cuerpo.2
Etológica o de comportamiento: El cortejo de las aves del paraíso (Paradisaeidae) es una adaptación que permite elreconocimiento de potenciales parejas de la misma especie. El macho que posee el plumaje y el cortejo más estimulante tiene mayor probabilidad de dejar mayor número de descendientes y menor número de híbridos. Por lo que aquellos machos que poseen plumajes especiales y que ejecutan cortejos elaborados poseen una gran ventaja selectiva.8
Adaptación a nivel molecular: Aunque la evolución porselección natural de rasgos morfológicos, fisiológicos y comportamentales es aceptada por la mayoría de los biológos, la importancia de la selección natural en la evolución molecular es discutida. En los últimos años se han desarrollado métodos estadísticamente robustos que permiten detectar evolución molecular adaptativa y se han identificado numerosos casos de adaptación molecular en varios sistemasdeenzimas desde los virus al hombre.9
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La radiación adaptativa es un proceso que describe la rápida especiación de una o varias especies para llenar muchos nichos ecológicos.
Este es un proceso de la evolución (evolución divergente en el caso de dos o más especies con origen común), cuyas herramientas son la mutación y la selección natural.
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En biología se denomina especiación al proceso...