Acidos Nucleicos y Cromatina

Estructura y Función de los ácidos nucleicos Estructura de los acidos nucleicos

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Diferencias estructurales del ADN y el ARN
Porque Timina en el ADN y uracilo en el ARN?
H20 La Citosina se deamina espontaneamente formando Uracilo Las enzimas reparadoras reconocen estas "mutaciones" y reemplazan Us por Cs NH3 Si no hubiera Timina (5-metil-U) como distinguir las U normales de lasresultantes de deaminación?

Estructura secundaria del ADN: Características Principales
Dos cadenas polinucleotídicas enrrolladas en una doble hélice dextrógira Las hebras son antiparalelas Los esqueletos azucar-fosfato en el exterior de la doble hélice Pares de base planares a trav és de puentes de hidrógeno, en el centro de la estructura A T (2 H) GC (3H) Pares de base separados 3.4 A. Una v ueltade hebra (3.4 nm) tiene aprox. 10 pares de base La posición de los esqueletos azucar-fosfato definen surco mayor y menor.

Porque 2´-dideoxi en el ADN ?
Dos grupos OH en el ARN lo hacen más suceptible a hidrólisis. El ADN sin OH en 2´ es más estable a hidrólisis.

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Odio ser una molécula de ADN!! Hay tanta información que debo recordar!! Flujo de información en la célula

Reglasde síntesis de moléculas informativas
Acidos nucleicos y proteínas Formados por un número limitado de subunidades Las unidades son agregadas secuencialmente formando cadenas lineales Cada cadena tiene un punto de inicio, avanza en una única dirección y tiene un punto de finalización Los productos de la síntesis primaria son modificados previamente a cumplir su función

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Reconocimientode ADN por proteínas

Señales en el ADN

Señales

Donde comienza y termina un gen? Donde comienza y termina una proteína?

Como leer estas señales? Legibilidad

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Legibilidad de secuencias de ADN
Accesibilidad a la secuencia
(surcos mayor y menor)

La estructura de los ácidos nucleicos no es rígida
Enlaces móvil es
Enlace N-glicosídico Enlace Fosfo-di-éster

Variación conmovimientos de pares de base Formas alternativas del ADN

Movilidad de las bases
dependiendo de la secuencia v aría el ángulo entre los pares de base Ladeado Abertura

Giro

Propulsor

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Propiedades fisico-químicas de los ácidos nucleicos Formas alternativas del ADN
forma A
condiciones de baja humedad híbridos ADN- ARN ARN- ARN 11pb/vta bases inclinadas surco mayor profundosurco menor angosto, mas expuesto

forma Z
alternancia de purinas y pirimidinas (CGCGCG) lev ógira 12 pb/vta surco mayor muy profundo y cerrado surco menor muy expuesto

1. Desnaturalización de los ácidos nucleicos
Desnaturalización Parcial del ADN necesaria para procesos de copiado Experimental Por temperatura Se analiza mediante espectroscopía Aumento de Temperatura Disociación cooperativade las hebras Aumento de Temperatura Regiones ricas en AT se disocian primero

Separación de hebras y formación de ovillos Tm : un reflejo de la composición promedio de un ADN
Depende del contenido de GC Tm 11 12 Temperatura de disociación T a la que la mitad del ADN está disociado

Denaturalización de los ácidos nucleicos: Tm
Tm : un reflejo de la composición promedio de un ADN
Se analizamediante espectroscopía Depende del contenido de GC Tm Temperatura de disociación T a la que la mitad del ADN está disociado

2. Renaturalización del ADN

Reacción Bimolecular
Encuentro de hebra complementaria Zipping de complementarias depende del tiempo y de la concentración de reactantes

Aplicaciones
Complejidad del genoma Búsqueda de secuencias específicas

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Reasociaciónde ADN: complejidad del genoma
Permite analizar complejidad de un genoma
Secuencias repetidas reasocian rapidamente Secuencias únicas reasocian lentamente

Cinética de reasociación del ADN genómico humano
Co t1/2 = 1 / k 2 k 2 = constante de segundo orden Co = concentración de ADN t1/2 = tiempo medio de reacción Fracciones obtenidas: reasociación rápida reasociación intermedia reasociación...