BIOTECNOLOGIA

EL GENOMA DE LOS DOMESTICADOS DE MANZANA (MALUS X DOMESTICA BORKH).

Se presenta un proyecto de secuencia de alta calidad del genoma de los domesticados de manzana (Malus x domestica). Se demuestra que un fenómeno relativamente reciente (más de 50 millones de años) en todo el genoma duplicación (CWG (DUPLICACIÓN DEL GENOMA) ) ha dado lugar a la transición de nueve cromosomas ancestrales a 17cromosomas en el Pyreae. Las huellas de mayores GWDS parte, la monofilia de la paleohexaploidy ancestral de eudicots. Reconstrucción filogenética de Pyreae y los del género Malus, en relación a taxa Rosaceae importante, identificó el progenitor de la manzana cultivada como M. sieversii. La expansión de las familias de genes informó a participar en el desarrollo del fruto puede explicar la formaciónde la pepita, fruta falsa Pyreae específica que se desarrolla por la proliferación de la parte basal de los sépalos, el receptáculo. En manzana, un clado de los genes MADS-box, que normalmente participan en el desarrollo de flores y frutas, se amplía para incluir a 15 miembros, al igual que otras familias de genes que intervienen en el metabolismo específico de las rosáceas, como el transporte yla asimilación de sorbitol.

El casero de manzana (Malus x domestica Borkh., De la familia Rosaceae, tribu Pyreae) es el cultivo principal fruto de las regiones templaCWG (duplicación del genoma) del mundo. Aquí se describe un proyecto de secuencia de alta calidad del genoma de 'Golden Delicious' la variedad de manzana diploide. Domésticos genotipos de manzana son altamente heterocigota, laimposición de los desafíos técnicos en la secuenciación del genoma y el montaje (1), mientras que permitiendo la identificación de un conjunto muy grande de SNPs (2).

Rosaceae pertenecen a los rosids, que incluyen un tercio de toCWG (duplicación del genoma) las plantas con flores (3). Considerando que el haploide (x) el número de cromosomas de la mayoría de las rosáceas son 7, 8 o 9, Pyreaetienen un distintivo x = 17. Pyreae tienen las familias de genes entre las diez especies de plantas secuencia CWG (duplicación del genoma) reveló manzana subclades específicos de genes que codifican MADS-box factores de transcripción y excesivamente representados los genes relacionados con el sorbitol, que pueden contribuir a los aspectos específicos de la manzana el metabolismo de los hidratos decarbono (el desarrollo y la Tabla 2 y que complementa el cuadro 7, y ver Discusión). El 71,2% de las secuencias genómicas que se anclados representan la parte del gen rico del genoma, que cubre hasta 90,2% de los genes asignaCWG (duplicación del genoma) a los cromosomas. La distribución de los elementos transponibles y genes predichos a lo largo de los grupos de ligamiento se reporta ensuplementario Figura 6. El número total de genes predichos para el genoma de la manzana (57.386, entre ellos algunos genes que pueden estar presentes sólo en uno de los dos cromosomas de un par) es el más alto reportado entre las plantas hasta la fecha (nota complementaria).
A sido considerado un ejemplo de allopolyploidization entre especies relacionadas con la conserva Spiraeoideae (x = 9) y Amygdaleoideae(x = 8), aunque un evento poliploidización dentro de linaje también ha sido hypothesized4.

sido considerado un ejemplo de allopolyploidization entre especies relacionaCWG (duplicación del genoma) con la conserva Spiraeoideae (x = 9) y Amygdaleoideae (x = 8), aunque un evento poliploidización dentro de linaje también ha sido hypothesized4.
(es un extracto del texto traducido pero no encuentrosentido al texto, ojo con ello)

Además, se analiza la variabilidad genética de las rosáceas y especies afines, la comparación de las especies, las tribus Pyreae Rosaceae y dos familias rosid. El contenido de genes y el orden de los cromosomas reunidos indican que GWDS tanto antiguas y recientes, se han producido. Ofrecemos un modelo que describe la evolución del genoma Pyreae, incluyendo...