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Desnaturalización del DNA
Cuando se rompen las fuerzas de unión entre las dos hebras del DNA, éstas acaban por separarse. Por tanto, el DNA desnaturalizado es de una sola hebra. La transiciónentre el estado nativo y el desnaturalizado se conoce como desnaturalización.´
La forma más corriente de desnaturalizar el DNA es por calentamiento. Otro agente desnaturalizante esel pH elevado porquecambia la carga de algunos grupos que forman parte de los puentes de hidrógeno. En agua destilada (con una fuerza iónica muy reducida) se produce la separación de las hebras. Este fenomeno se debe aque en agua muy pura, la fuerte repulsión entre las cargas negativas de los grupos fosfato no es contrarrestada por los correspondientes contraiones (Na+, Mg+2).


Un parámetro muy útil paracaracterizar la evolución de la fusión es la temperatura a la que el aumento de la A260 ha llegado a la mitad de su camino. Esta temperatura se llama temperatura de fusión (Tm). Se ha comprobado que laTm aumenta con el contenido de G+C (Figura de la derecha). Como el par de bases G-C está unido por tres puentes de hidrógeno (a diferencia del par A-T que sólo presenta 2) se requiere una temperatura másalta para desnaturalizarlo.
Los reactivos que incrementan la solubilidad de las bases (como el etanol) disminuyen la Tm, ya que reducen la interacción hidrofóbica que las mantiene unidas (Figura dela izquierda).
De esto se deduce que tanto los puentes de hidrógenocomo las interacciones hidrofóbicas cooperan para formar una estructura estable. Si se reduce o elimina cualquiera de estasinteracciones, la estabilidad disminuye y la Tm es menor
La desnaturalización de ácidos nucleicos como el ADN por altas temperaturas produce una separación de la doble hélice, que ocurre porquelos enlaces o puentes de hidrógeno se rompen. Esto puede ocurrir durante la reacción en cadena de la polimerasa; las cadenas del ácido nucleico vuelven a unirse (renaturalizarse) una vez que las condiciones...