Examen Bioquimica

1. La insulina es una proteína que consiste de dos cadenas polipeptidicas llamadas A y B. La insulina de diferentes organismos ha sido aislada y secuenciada. Las insulinas de humano y de pato tienen la misma secuencia de aminoácidos con excepción de seis resuduos de aminoácidos que se muestras a continuación.

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Es el punto isoeléctrico de la insulina humana más bajo o más alto que el dela insulina de pato?
Explique:

R= El punto isoeléctrico de la insulina humana es más alto que el de la insulina de pato, ya que la de pato tiene un residuo de ácido glutámico, que en su radical presenta un gama carboxilo cuyo pKa estará cerca de 4.07, dispondrá la proteína de una carga negativa extra en comparación con la humana, que para que sea neutralizada, debería disminuir el pH, lo queprovocará que su punto isoeléctrico esté por debajo de la humana.  



2. Ud. Desea secuenciar la cadena ligera de un inhibidor de proteasa de a planta Bassica nigra. El rompimiento de la cadena ligera por trispsina y quimotripsina produjo los siguientes fragmentos.
Deduzca la secuencia de esa cadena de polipeptídica.


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R=Arg-Ile-Pro-Lys-Cys-Arg-Lis-Phe-Gln-Gln-Ala-Gln-His-Leu-Arg-Ala-Cys-Gln-Gln-Trp-Leu-His-Lis-Gln-Ala-Asn-Gln-Ser-Gly-Gly-Gly-Pro-Ser

3. El tratamiento de un polipéptido con 2-mercaptoetanol produjo dos polipéptidos

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el tratamiento de todo el polipéptido con tripsina produjo fragmentos con la siguiente composición de aminoácidos

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Arme el péptido e indique la posición de los enlaces disulfuro en el péptido intacto.



4. Elgrupo amino de glicina tiene un pKa de 9.6 y puede encontrarse en la forma protonada (-NH3) o como base libre (-NH2) debido a la reacción en el equilibrio

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a) En qué intervalo de pH puede utilizarse la glicina como regulador eficiente debido a su grupo amino?
Comúnmente un regulador es eficiente cuando de un total de 11 partes, se conserva una en la capacidad de captar protones y 10en la capacidad de cederlos o una en la capacidad de cederlos y 10 en la de aceptarlos. La primera condición ocurre en un pH que esté una unidad por debajo del pKa y la segunda en un pH que esté una unidad por encima del valor del pKa.


b) En una solución 0.1 M de glicina a pH de 9 qué fracción de la glicina tiene su grupo amino en la forma –NH3 + ?
La ecuación de Henderson Hasselbachestablece que el pH = pKa + log (sal)/(ácido), de acuerdo a esto, pH – pKa = log (sal)/(ácido) y 9 – 9.6 = -0.6
Si se obtiene el antilogaritmo de -0.6 se tiene como resultado 0.2511, que indica la proporción de sal con respeto a la de ácido es decir, la proporción del grupo amino disociado con respecto al protonado. En conjunto habría 0.2511 formas disociadas y 1 forma protonada del grupo amino enese pH, es decir un total de partes entre disociada y protonada de 0.2511 + 1 = 1.2511 partes totales. En este caso, el total de partes debe ser 0.1 moles por litro (dado que es 0.1M) de las cuáles 0.2511/1.2511 deben ser aminos disociados y1/1.2511 deben ser aminos protonados.
Se debe multiplicar entonces 0.2 (que es el resultado de dividir .2511/1.2511) por 0.1M, el resultado es 0.02 y si semultiplica 0.8 (que resulta al dividir 1/1.2511) por 0.1M, el resultado es 0.08. En conclusión, por cada 0.1 moles de grupo amino que haya por litro, 0.02 moles deben ser de grupos amino disociados y 0.08 moles de grupos amino protonados.
c) Cuánto KOH 5M debe adicionarse a 1 Lt de glicina 0.1 M a pH de 9 para llevar exactamente el pH a 10?
Por cada OH que se añada se transforma un aminoprotonado en amino disociado, para alcanzar pH 10 debe haber una proporción de aminos disociados/aminos protonados cuyo logaritmo resulte 0.4, ese número es 2.512 por tanto, la proporción por alcanzar será 2.512 aminos disociados por cada 1 amino protonado, es decir de un total de 3.512 grupos, uno debe estar protonado y 2.512 disociados. Si el total de glicnas es 0.1 moles por litro, hay 0.1...