FILOGENETICA

FILOGENIA BACTERIANA MEDIANTE EL ANÁLISIS DEL RRNA 16S
J. MAURICIO M. HERRERA CUADRA
Carrera de Biología, Facultad de Estudios Superiores Iztacala, Universidad Nacional Autónoma de México, Tlalnepantla, Estado de
México 54090, México

INTRODUCCIÓN A LA FILOGENIA MOLECULAR
La filogenia es el estudio de la evolución y desarrollo de las especies. La comparación de
secuencias de algunasmacromoléculas, es la forma mas precisa y confiable para inferir en las relaciones
filogenéticas. Estos datos, son preferibles sobre de otros métodos moleculares por poseer cercanías
evolutivas, debido a que permiten interpretaciones cuantitativas y directas, además que van
conformando una creciente base de datos para subsecuentes referencias.
Nos encontramos en un nuevo periodo para lamicrobiología (y, en especial, para la microbiología
ambiental) y esto es debido a la gran información que encontramos cuando utilizamos los nuevos
métodos en biología molecular a la hora de caracterizar los microorganismos. A pesar de que se sabe
que un gran porcentaje del balance total de la biosfera depende de los microorganismos, sólo se
conocían alrededor del 1% del total. Esto es debido a lasdeficiencias que propiciaban los estudios
usados que estaban basados en caracteres morfológicos, fisiológicos (necesidad de nutrientes) y
estructurales (diferencias entre lípidos de membranas). Para todos ellos era prerrequisito esencial el
cultivo, pero los medios actuales de cultivo no dejaban cultivar ni una mínima parte de los
microorganismos existentes (por distintas razones como pueden serdesconocimiento de los nutrientes
requeridos, de las condiciones de la atmósfera, etc.).
Las técnicas del DNA recombinante nos ayudan a subsanar estos problemas y a clasificar a los
organismos de un modo más correcto, de acuerdo a su filogenia. Estos estudios podemos hacerlos
estudiando la secuencia total de nucleótidos del genoma del microorganismo, pero actualmente se
utilizan losestudios del rRNA 16S o 18S, porque son secuencias que se han mantenido bastante
uniformes a lo largo de la evolución, y por eso se ven claramente las diferencias entre los distintos
microorganismos y se pueden realizan árboles filogenéticos y esquemas evolutivos.
Antes del desarrollo de los métodos de secuenciación de bases, era imposible conocer las
relaciones evolutivas que conectaban todas lasformas de vida, así como dibujar un árbol evolutivo
general.
Hace más o menos dos décadas los organismos celulares se dividían en 5 reinos: Animalia,
Plantae, Fungi, Protista y Monera. Adicionalmente los constituyentes de estos cinco reinos eran
caracterizados en dos grupos eucariotas o procariotas, de acuerdo a si poseían una membrana rodeando
a su material genético (membrana nuclear). Secreyó que la máxima diversidad estaba en los eucariotas,
y se le concedió a los procariotas el galardón de uniformes en cuanto a sus propiedades.
El paso principal llegó con Carl Woese, quién comparando secuencias de rRNA estableció un
árbol filogenético que puede ser usado para relacionar todos los organismos, así como para reconstruir la
historia de la vida. Así se reconocieron las treslíneas primarias de evolución, denominadas dominios:
Eucarya (eucariotas), Bacteria (inicialmente eubacterias) y Archeae (inicialmente arqueobacterias).

Los estudios de la subunidad pequeña del rRNA han hecho que haya una revisión de todos estos
conceptos y nociones. Estos estudios filogenéticos basados en el rRNA nos dan una información que
hace organizar a los distintos organismos de otro modocomo podemos ver en el árbol de la vida.

Este árbol se ha realizado teniendo en cuenta las distancias evolutivas entre los distintos
organismos. Como se ve, cuando los datos son estructurados en árboles se observan tres dominios o
grupos primarios: Archeae, Bacteria y Eucarya. Y podemos observar cosas curiosas insospechadas hasta
ese momento, como que aunque Archeae y Bacteria son ambas...