Green fluorecense protein

Visualización de la estructura tridimensional de la proteína verde fluorescente

La visualización de la estructura tridimensional de las proteínas es un punto de estudio muy importante para losinvestigadores ya que ayuda a comprender como las estructuras de las proteínas contribuyen a su función. Para esto se han utilizado técnicas como la difracción de rayos X y la resonancia magnéticanuclear las cuales determinan la ubicación tridimensional de los átomos que forman parte de la estructura de la proteína.
Estos datos son almacenados en formato PDB, que permite mediante la utilizaciónde programas como Chimera una representación bidimensional de la estructura tridimensional de la proteína estudiada, permitiendo su representación en distintas variantes, útiles para diversosobjetivos.
En la actividad se utilizó el repositorio de estructuras 3D de biomoléculas PDB y el programa Chimera, el primero para seleccionar una de las proteínas presentadas en la molécula del mes, en estecaso se escogió la proteína verde fluorescente GFP, con código de acceso 1GFL (Yang y col., 1996), mediante el fichero PDB correspondiente a esta proteína mientras se utilizó Chimera para lavisualización molecular de la proteína escogida y se construyó diferentes representaciones moleculares que reflejasen distintas propiedades de la molécula.
La proteína verde fluorescente es una proteínaextraída de una medusa que vive en las aguas templadas del Pacífico Norte, en la medusa esta proteína funciona convirtiendo la luz azul de otra proteína bioluminiscente en luz verde, mientras que ensoluciones purificadas, absorbe luz ultravioleta del sol y luego la emite como luz verde.
Esta característica la ha hecho muy útil para las investigaciones ya que permite ver lo que está ocurriendodentro de los organismos, por ejemplo si se une a un virus, se puede monitorizar como se ha esparcido este virus por el organismo, ya que las zonas en las que se ha expresado, al ser expuestas a la luz...