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Los estudios sobre la Flora de Puerto Rico, desde los tiempos del descubrimiento de las Antillas, culminaron con la publicación de la obra de Britto Y Wilson Botany of Puerto Rico an Virgen Island-192401930 y 1980 .En 1982 se hizo revisión donde se añanden numerosas especies y pone la nomenclatura al día.
Actualmente se encuentran 225 especies endémicas (especies resgistradas en lugaresespecíficos) y es posible que se hallen varias especies no descritas
El principal enemigo de la vegetación es la destrucción del amiente, minería, explotación forestal, desarrollo urbano y turismo. Se debe hacer lo posible por conservar los ambientes frágiles, preservando el los ambientes ecológicos en su forma primitiva. Deben mantenerse las especies originales y no sustituirlas por especies exóticas.,el paisajismo debe usar flora nativa en vez de exóticas. En áreas dedicadas a una explotación intensiva puede sustituirse las especies nativas por otras introducidas y de gran rendimiento con fines de aprovechar el terreno produciendo madera, siempre que la siembra sea supervisada por peritos forestales. Los ambientes de Guánica y Susúa han sido en parte modificados y perdidos por la práctica desustituir la flora natural por especies introducidas.
Los acuerdos internacionales que tienden a prohibir la exportación de ciertas plantas llenan una necesidad, sobre todo para las familias de plantas mas codiciadas como las orquideas y las Cactáceas En ciertos casos esta ley frustra su propósito prohibiendo la explotación y difusión de estas plantas siendo su ambiente nativo amenazado .suexpotración en muchos casos favorecería su conservación y propagación.
La vegetación y el medio ambiente estan amenazadas hoy dia en el Caribe, y en Puerto Rico, tanto por la naturaleza que por el hombre.
El primer factor son los huracanes. La devastación de árboles caidos, ríos salidos, deslizamientos de terrenos que hacen desaparecer la cubierta vegetal.muchas especies pueden ser aniquiladas, losbosques se regeneran más tarde, pero con especies distintas.
El hombre y sus actividades es el principal enemigo del medio ambiente los animales que cuida y protege, las cosechas que cultiva, la explotación minera y forestal, la expansión de las cosechas que cultiva, turismo, todo esto ha sido y es en la actualidad un factor amenazante para el medio ambiente y la vegetación.
Los colonos sededicaron al cultivo y a la ganadería, grandes áreas se dedicaron a pastizales con la consiguiente destrucción de los bosques, la concentración de animales a ciertas áreas provocó la degeneración de los suelos y la erosión ha hecho el resto.
La minería en Puerto Rico ha sido un factor de menor importancia para la destrucción del ambiente .La busqueda moderna de buscar fiuentes de energía fósil podríaafectar algunas áreas cubiertas de bosques, el establecimiento de refinerias petroleras (ahora cerradas), daña la vegetación.
Los bosques han estado en merma en las antillas tanto por la explotación forestal sin reforestación , como por los cortes con fines agrícolas u otros. Se han sembrado esporádicamente algunos árboles, pero una vez los bosques han desaparecido no se regeneranespontaneamente. Hay degradación de los suelos con un cambio en la ecología que dificulta el volver a establecer el bosque primitivo.
El turismo es la industria que ha tenido efectos variados en las Antillas .Las áreas cerca de las playas y los hoteles turísticos han estado destruyendo ambiente ecológico ,ej Area de Dorado y Fajardo.
La vegetacitón de una manigua esta rapidamente desapareciendo para darsitito a residencias en la playas hoteles y áreas recreativas. Varias plantas raras ya no se encuentran o se han vuelto sumamente escasas.
Los bosques tropicales albergann más vida silvestre y especies de plantas que cualquier otro lugar en la Tierra .A su vez estos bosques son extremadamente vulnerables a la intervención humana particularmente en las islas donde hay especies nativas
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