Lipidomics

Lipidómica : nuevas herramientas y aplicaciones
Una vez visto simplemente como un depósito para el almacenamiento de carbono , los lípidos ya no se echan como espectadores en el drama de los sistemas biológicos . El campo emergente de la lipidomics es impulsado por la tecnología , en particular la espectrometría de masas , sino también por los enfoques complementarios para la detección ycaracterización de los lípidos y las enzimas de la biosíntesis en células vivas. El desarrollo de estas herramientas integradas promete un gran avance en nuestra comprensión de las diversas funciones biológicas de los lípidos.
Los lípidos no están codificados genéticamente . En lugar de ello , al igual que otras moléculas pequeñas que se generan y se metabolizan por enzimas que se ven influidas por elentorno de un sistema biológico dado , por ejemplo por la dieta y la temperatura . Aunque todavía poco definida , algunas estimaciones han puesto el número de entidades químicas distintas dentro de la esfera de lípidos entre 10.000 y 100.000. Aunque no está claro cómo y por qué la naturaleza genera esta asombrosa diversidad , existe una conciencia cada vez mayor a través de muchas disciplinas dela importancia crítica de los lípidos en todos los aspectos de la vida .
En primer lugar , coordinado el anabolismo y el catabolismo de los lípidos es un integrador de clave molecular de la homeostasis de energía , estructura de la membrana y la dinámica , y la señalización ( Figura 1 ) con los desequilibrios en el metabolismo de lípidos que contribuye a diversos fenotipos y estados de enfermedad. En segundo lugar, hay un número creciente de fármacos que se dirigen metabólica de los lípidos y las vías de señalización , incluyendo los agentes bien conocidos y rentables para reducir el colesterol (estatinas) e inhibidores de la ciclooxigenasa . Para la intervención terapéutica en enfermedades que van desde la inflamación y el cáncer a las enfermedades metabólicas , los investigadores estánbuscando los reguladores de lípidos específicos de numerosos objetivos , incluyendo fosfatidilinositol (PI ) 3 - quinasas , receptores nucleares de hormonas ( por ejemplo , receptor X del hígado , LXR ; activado por el proliferador de peroxisomas receptores , PPAR ) , esfingosina quinasas , y ceramida. Un ejemplo reciente es FTY720 , aprobado para el tratamiento de la esclerosis múltiple enoctubre de 2010 , un inmunosupresor que se dirige a los receptores de la esfingosina - 1 - fosfato ( pero curiosamente no inhibe la serina palmitoil transferasa , a diferencia de su myriocin compuesto madre, un producto natural). La escasez de herramientas pertinentes ha dado lugar a inversiones en programas para el desarrollo de nuevos enfoques para la investigación de los lípidos. En conjunto, estosesfuerzos han dado un nuevo impulso al campo (que se refleja en parte por el aumento del número de publicaciones y conferencias dedicadas a los lípidos ) , que promete abordar cuestiones fundamentales de la función de los lípidos y de satisfacer las demandas prácticas de las ciencias aplicadas. El objetivo de este Manual es presentar los conceptos básicos detrás de bioquímicos (masa basada en laespectrometría ) lipidomics , para discutir cómo se están integrando estos enfoques con técnicas complementarias , y para ofrecer una visión sobre el futuro del campo .
Lipidómica espectrometría de masas basado
Los primeros informes de la espectrometría de masas (MS ) análisis de mezclas complejas de lípidos a través de técnicas de ionización suaves ( ionización asistida por matriz de desorciónpor láser , MALDI , y de ionización electrospray , ESI ) se remontan a la década de 1990 ( Han y Gross, 1994 ; Kim et al. , 1994 ) . Un gran número de métodos se han desarrollado desde entonces, y muchos lípidos biológicamente importantes ahora puede ser analizado en forma bastante rutinaria . Sin embargo , a diferencia de la genómica y la proteómica , que están bien representados en las diversas...