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Última edición hace 14 días por EricEnfermero

Microsatélite

En genética, los microsatélites (SSR o STR por sus acrónimos en inglés para simple
sequence repeat y short tandem repeat) son secuencias de ADN en las que un fragmento
(cuyo tamaño va desde dos hasta seis pares de bases) se repite de manera consecutiva.
La variación en el número de repeticiones, y no la secuenciarepetida, crea diferentes
alelos.
Generalmente se encuentran en zonas no codificantes del ADN. Son neutros, codominantes y poseen una alta tasa de mutación, lo que los hace muy polimórficos. Son
utilizados como marcadores moleculares en una gran variedad de aplicaciones en el
campo de la genética, como pueden ser parentescos y estudios de poblaciones. Esto se
debe a su capacidad para generar unahuella genética personal o perfil genético.
Cabe destacar que, para cada uno de los STRs que podemos encontrar en el genoma, se
establecen en la población frecuencias en el número de repeticiones, es decir, que para
cada STR existe un determinado rango en el número de repeticiones "normal" dentro de la
población (por ejemplo, entre 10 y 13 repeticiones para un STR concreto), mientras que
hay otrosnúmeros de repeticiones que se establecen con menos frecuencia en ese
marcador.

Constitución
Un microsatélite esta típicamente conformado por un motivo repetitivo, en el cual se
encuentra contenido la secuencia repetida, y dos regiones flanqueantes, las cuales se
encuentran a ambos lados del motivo repetitivo. Sin embargo, hay casos en los que
puede haber dos motivos repetitivos o más dentro de unmicrosatélite. Para que un
microsatélite sea considerado útil como marcador molecular, toda la variación de la
secuencia o polimorfismo debe hallarse dentro del motivo repetitivo, mientras que las
regiones flanqueantes deben estar altamente conservadas, al punto de no presentar
ninguna variación de secuencia.
Para poder diferenciar dos microsatélites que se diferencien sólo en su número derepeticiones, necesitamos hacer una PCR. Para ello, se diseñan primers o iniciadores
(también llamados cebadores), que son pequeños fragmentos de ADN complementarios
a las regiones flanquentes, y que permiten amplificar (o producir un alto número de
copias) nuestro microsatélite.
Los fragmentos así producidos son separados de acuerdo a su longitud en pares de
bases a través de una electroforesis en gelde agarosa. Partiendo de la hipótesis de que
en un microsatélite sólo varía el número de repeticiones dentro del motivo repetitivo,
podemos saber cuántas repeticiones tiene nuestro microsatélite por el tamaño que
alcanza la banda. Una vez echa la electroforesis, podemos comparar unos microsatélites
con otros, siempre y cuando sean alelos de un mismo motivo repetitivo.
Estos alelos se heredarían demanera codominante, es decir, que en cada locus un
individuo podría presentar uno o más alelos, dependiendo del número de juegos de
cromosomas que posea. Por ejemplo, los humanos somos diploides, es decir, poseemos
dos juegos completos de cromosomas y por lo tanto para un locus de un microsatélite,
podemos presentar un alelo (si ambos progenitores nos transmitieron alelos de la misma
secuencia ytamaño) o dos alelos (si cada progenitor nos heredó un alelo de tamaño
diferente).
Se ha probado que los microsatélites son versátiles marcadores moleculares,
particularmente para los análisis poblacionales, pero no por ello se encuentran ausentes
de limitaciones. Los microsatélites desarrollados para unas especies particulares pueden
con frecuencia ser aplicadas a especies emparentadas, pero elporcentaje de loci que se
amplifican satisfactoriamente puede disminuir cuando aumenta la distancia genética.
Otras de sus limitaciones, mucho más prosaicas, se deben a contaminación de las
muestras, que puede dar lugar a falsos perfiles, sustancias que sean inhibitorias de la
reacción de PCR y que no nos permitan conocer el perfil genético del material
encontrado, la degradación del ADN, que se...