Optimización de caracteres sobre una topología
Páginas: 3 (595 palabras)
Publicado: 13 de mayo de 2010
OPTIMIZACIÓN DE CARACTERES SOBRE UNA TOPOLOGÍA
Objetivo
Analizar los diferentes criterios de optimización para caracteres binarios y multiestado.
Determinar la homoplasia(convergencias/paralelismos) presente en los diferentes criterios de optimización.
0. ¿Considera apropiado mapear el nodo que incluye al grupo externo (out)?
Si lo considero apropiado. El grupo externo esnecesario para mirar la polaridad del carácter. Es un método comparativo. Es el grupo que me indica la evolución del carácter. El presenta el estado mas plesiomorfico en el cladograma.
1. Para loscaracteres binarios evalúe el efecto de optimización bajo C-S, Dollo y
Fitch.
La optimización de fitch se emplea para caracteres no aditivos y permite libre reversibilidad. Se pueden tener variascladogramas igualmente parsimoniosos, dependiendo de las asignaciones de estados en los nodos internos. Fig. 1
La optimización de Camin-Sokal constriñe las trasformaciones del carácter tal que unavez un estado ha sido adquirido nunca podrá perderse. Fig. 1.a
La optimización de Dollo permite libre reversibilidad, requiere que la polaridad del carácter sea preespecificada. Fig. 1.b
Laobtención del árbol mas parsimonioso depende obviamente de la optimización que se elija y de la distribución de los estados del carácter en el cladograma.
2. Para los caracteres multiestado evalúe eluso de caracteres aditivos lineales
versus no ordenados
“En un mundo de vertebrados que información tiene tener vértebras”. Tanto las simplesiomorfias como las autopomorfias no generaninformación sobre las relaciones de los taxa. En este caso los estados del carácter son todos autopomorfias, por lo tanto no me dan ninguna información. Teniendo esto en cuenta, si evaluamos el uso decaracteres aditivos lineales versus no ordenados en todos los árboles siempre se van a dar 10 pasos. Es independientemente del criterio de optimización.
3. Para el carácter 8 evalúe un modelo aditivo...
Objetivo
Analizar los diferentes criterios de optimización para caracteres binarios y multiestado.
Determinar la homoplasia(convergencias/paralelismos) presente en los diferentes criterios de optimización.
0. ¿Considera apropiado mapear el nodo que incluye al grupo externo (out)?
Si lo considero apropiado. El grupo externo esnecesario para mirar la polaridad del carácter. Es un método comparativo. Es el grupo que me indica la evolución del carácter. El presenta el estado mas plesiomorfico en el cladograma.
1. Para loscaracteres binarios evalúe el efecto de optimización bajo C-S, Dollo y
Fitch.
La optimización de fitch se emplea para caracteres no aditivos y permite libre reversibilidad. Se pueden tener variascladogramas igualmente parsimoniosos, dependiendo de las asignaciones de estados en los nodos internos. Fig. 1
La optimización de Camin-Sokal constriñe las trasformaciones del carácter tal que unavez un estado ha sido adquirido nunca podrá perderse. Fig. 1.a
La optimización de Dollo permite libre reversibilidad, requiere que la polaridad del carácter sea preespecificada. Fig. 1.b
Laobtención del árbol mas parsimonioso depende obviamente de la optimización que se elija y de la distribución de los estados del carácter en el cladograma.
2. Para los caracteres multiestado evalúe eluso de caracteres aditivos lineales
versus no ordenados
“En un mundo de vertebrados que información tiene tener vértebras”. Tanto las simplesiomorfias como las autopomorfias no generaninformación sobre las relaciones de los taxa. En este caso los estados del carácter son todos autopomorfias, por lo tanto no me dan ninguna información. Teniendo esto en cuenta, si evaluamos el uso decaracteres aditivos lineales versus no ordenados en todos los árboles siempre se van a dar 10 pasos. Es independientemente del criterio de optimización.
3. Para el carácter 8 evalúe un modelo aditivo...
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