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La Historia del Museo Nacional de Historia Natural de México comienza en las Postrimerías del gobierno colonial español y fue el primer Museo público de HistoriaNatural que se fundó en el Nuevo Mundo. Desde entonces tiene tradición científica.
Tomando parte en una comisión enviada por Carlos IV a la Nueva España con el objeto de completar e ilustrar la obramonumental del doctor don Francisco Hernández vino don José Longinos Martínez, quien radicó en la Ciudad de México, y a cuyas iniciativa y aportación personales se debe la fundación del Gabinete deHistoria Natural, en la casa número 89 de la calle de Plateros, el 25 de agosto de 1790. Contribuyeron con donativos al enriquecimiento de las colecciones del Gabinete, don Fausto Elhúyar y don José AntonioÁlzate y Ramírez, entre otras muchas personas.
A causa de la Guerra de Independencia estuvieron en peligro de perderse las colecciones, pero en su mayor parte fueron rescatadas y enviadas a laUniversidad, en donde se unieron a las de Arqueología, que por órdenes del virrey Bucareli habían sido instaladas en la biblioteca de la misma institución, siendo establecidas en ella, el año de 1822, elConservatorio de Antigüedades y el Gabinete de Historia Natural.
Bajo la presidencia de Guadalupe Victoria y a iniciativa de Lucas Alamán, se fundó en la Universidad, con los contingentes citados, elMuseo Nacional. A punto estuvo de ser trasladado primeramente al Hospital de Naturales o al del Espíritu Santo, según se prefiriera (1827), al Colegio Mayor de Santos (1830). Sin que fuera movido porentonces.
En 1831 por decreto de Vicente Guerrero se creó definitivamente el Museo, el cual entonces quedó gobernado por una junta directiva presidida por Pablo de la Llave.
En 1843 el Ministerio dela Instrucción Pública dispuso en 1843 que el Museo quedara anexo al Colegio de Minería. Más tarde se formó un establecimiento con el Museo Mexicano, el Jardín Botánico, el Archivo General y la...