Proteomica

ÍNDICE

1. Introducción.
2. Proteómica.
3. Separación de proteínas.
4. Proteómica y su relación con el desarrollo de medicamentos.
5. Proteínas blanco y sitios de ligadura.
6. Integración de cromatografía líquida y análisis de espectrometría de masas.
7. Aplicaciones de la proteómica química.

INTRODUCCIÓN

La célula es un mundo maravilloso que está constituidopor millones de moléculas; entre ellas las proteínas, que están encargadas de realizar sus funciones (son las responsables de que nosotros podamos reaccionar como seres vivos) y sus alteraciones hacen que aparezcan enfermedades; y por este motivo es muy importante conocer a las proteínas, función que se encarga de realizar la PROTEÓMICA.
El estudio del genoma, por medio de la genómica, ha permitidoir a lo más profundo del conocimiento de la composición del material genético de los organismos que han sido estudiados. Se conoce el número de genes, se les ha clasificado y se ha logrado determinar su localización en los cromosomas. Si bien el avance ha sido espectacular, aún quedan dudas importantes por resolver y que se enfocan hacia sus productos de expresión: las proteínas.
El términoProteómica se ha asociado tradicionalmente con la separación de un gran número de proteínas de una célula u organismo mediante 2D-PAGE. Según esto, la Proteómica comenzó en los años setenta cuando se empezaron a construir bases de datos de proteínas utilizando la electroforesis bidimensional. Sin embargo, la identificación de las proteínas era difícil debido a la falta de métodos analíticos rápido ysensibles para la caracterización de las proteínas. En los años noventa la espectrometría de masas surge como un método analítico muy poderoso, ya que limita la mayoría de las limitaciones del análisis de proteínas. Este desarrollo, junto con la disponibilidad de los genomas secuenciados marca el comienzo de una nueva era. Actualmente muchas áreas de estudio han sido agrupadas dentro de laProteómica. Se pueden incluir, entre otros, los estudios de interacciones de proteínas, de modificaciones pos-traduccionales, el análisis funcional de las proteínas y estudios de localización.

PROTEÓMICA

El término “Proteoma” fue usado por vez primera en 1995 para describir el conjunto de proteinas de un genoma, en una célula o un tejido.

De forma imperceptible, la palabra Proteoma dio lugar a unanueva disciplina, la “Proteómica”.

Esencialmente la Proteómica es el estudio a gran escala de los productos génicos de un genoma mediante métodos bioquímicos, con el fin de obtener una visión global integrada de los procesos celulares.

Se puede hablar de dos tipos de Proteómica: Proteómica de expresión y Proteómica del mapa celular.

La Proteómica de expresión es el estudio cuantitativode la expresión de proteínas entre muestras que difieren en alguna variable. En esta estrategia se compara la expresión del Proteoma total o de subproteómas entre diferentes muestras. La información obtenida puede permitir la identificación de nuevas proteínas implicadas en transducción de señales, la identificación de proteínas específicas de una enfermedad y proteínas de interés en microbiologíamédica.

La Proteómica del mapa celular o estructural es el estudio de la localización subcelular de las proteínas y de las interacciones proteína-proteína, mediante la purificación de orgánulos o complejos y la posterior identificación de sus componentes mediante espectrometría de masas.

También se utiliza el término de Proteómica funcional para referirse a diversas aproximacionesproteómicas que permiten el estudio y caracterización de un grupo de proteínas determinado proporcionando información importante sobre señalización, mecanismos de la enfermedad o interacciones proteína-fármaco.

Para caracterizar un Proteoma de una célula es importante tener en cuenta que el Proteoma es dinámico y que es reflejo del medio ambiente en el que es estudiado.

SEPARACIÓN DE PROTEÍNAS...