Virologia

TAXONOMÍA Y CLASIFICACION DE VIRUS

Taxonomía Moderna de los Virus
El numero de virus como patógenos o pasajeros silenciosos de otros organismos, desde bacterias a los mamíferos, es muy larga. Como se han explorados nuevos nichos de vida y como se ha aumentado la sensibilidad y especificidad en las técnicas de detección, la lista de los virus se ha expandido. Hoy en día, la ComunidadInternacional de Taxonomía de los Virus (ICTV) reconoció cerca de 1,550 especies de virus, pero aproximadamente 30,000 cepas de los virus están siendo investigando en diversos campos de la virología y la biología. La ICTV es la “corte internacional” de expertos que manda sobre los nombres y relaciones de todos los virus, pero solo a nivel de especies.
La taxonomía de los virus se ha visto descrita como“tema polarizante, basado en el uso opcional de datos”. Reconociendo este problema intrínseco, la ICTV tomo tempranamente la iniciativa en el manejo de datos electrónicos y ha apoyado el desarrollo de una base de datos universal de los virus, ICTVdB, desde 1991. La ultima oración en el capítulo de Melnick, “taxonomía y clasificación de los virus”, en la edición previa de este manual, refería aldesarrollo reciente del ICTVdB. A pesar de que originalmente había sido descrito como una herramienta en la investigación taxonómica, ICTVdB próximamente estará disponible como una continua fuente de actualización para la clínica u otros usos. Este capítulo está dedicado a Melnick y a sus postulados. Si se describen brevemente los descubrimientos recientes en la taxonomía de los virus,describiría el código decimal de clasificación que ha emergido en la construcción de bases de datos, e ilustra la unidad de las bases de datos con una cantidad de virus causales de enfermedades humanas.
Mientras este capítulo estaba siendo preparado, la ICTVdB fue aumentada con datos sobre síntomas de virus que infectan humanos y ahora concuerda con el código de enfermedades de la OMG.
DescubrimientosRecientes de la Taxonomía de los Virus
La taxonomía de los virus cambia rápidamente, con cambios que van desde lo trivial (uso del latín para nombres de especies) a la profunda reorganización derivada de la explosión de las secuencias de información. El sistema universal de taxonomía de los virus ahora acepta la clasificación linear como lo son niveles de orden, familia, subfamilia, genero yespecie. El sufijo “virales” identifica a los órdenes. Las familias están identificadas por el sufijo “viridae”, las subfamilias son identificadas por el sufijo “virinae”, y los géneros son identificados por el sufijo “virus”. La importancia de la designación de subespecies distinguibles, subespecies, cepas y aislamientos en el desarrollo de vacunas, diagnostico, etc., es reconocido, pero estos nivelesinferiores no son formalmente clasificados por la ICTV. Alrededor de los últimos 5 años la clasificación en subgéneros de algunos virus que infectan humanos ha sido drásticamente reorganizada (Tabla 1). Algunos géneros han escapado de la atención de taxónomos que clasifican según criterios similares y aquellos que se basan en su genómica, primordialmente debido a que la información secuenciadaha ayudado a redefinir su temprana clasificación.
Tabla 1. Familias las cuales han tenido los mayores cambios desde 1995 en la clasificación según género y subgénero de los virus que infectan humanos.
Cambios taxonómicos
Familias
De nivel de especie a serotipo/cepa
Adenoviridae, Astroviridae, Bunyaviridae, Flaviviridae, Picornaviridae, Reoviridae, Retroviridae, Togaviridae
Algunos cambiosArenaviridae, Coronaviridae, Flamiviridae, Hepadnaviridae, Orthomyxoviridae, Parvoviridae, Poxviridae
Cambios más importantes en la creación de algunas nuevas familias de géneros
Calicivirdae, Filoviridae, Herpesviridae, Paramyxoviridae, Retroviridae, Rhabdoviridae, Polyomaviridae, Papilomaviridae

Código Internacional de Enfermedades
Al inicio de los días de la taxonomía de los virus, las...