genetica

Introducción
A la hora de estudiar una proteína, lo que más nos interesa es su función. Actualmente, 
sabemos que hay una gran relación entre la estructura que adopta la proteína y la función que   realiza.   Tener   la   estructura   tridimensional   (3D)   una   proteína   nos   puede   ayudar   a 
averiguar   qué   aminoácidos   contribuyen   a   su   estabilidad,   por   qué   una  región   está   más 
conservada o menos,  qué  aminoácidos  forman la  superficie de la  proteína, cuáles  son los directamente involucrados en la función e incluso los que interaccionan con otra molécula.
El principio que se esconde detrás de la modelización por homología es la suposición de 
que la estructura está más conservada que la secuencia. Los dominios funcionales de las 
proteínas   suelen  estar   estructuralmente   conservados   y   es,   precisamente,   esto   lo   que   nos 
permite poder modelar una secuencia basándonos en las características estructurales de otras proteínas conocidas, a las que llamaremos templates.
Los pasos para la creación del modelo son:
1. Búsqueda de los templates
2. Alineamiento de nuestra secuencia con los templates
3. Obtención del modelo
4.Evaluación del modelo
La Hemoglobina β
La hemoglobina (Hb) es la proteína encargada de transportar 
el oxígeno a los tejidos. Está formada por cuatro cadenas: α1, α2 (en rojo) y 2 cadenas β (en azul). A cada una de estas cadenas se une 
un grupo hemo, caracterizado por tener un átomo de hierro capaz 
de captar una molécula de oxigeno.
Al estudiar evolutivamente el gen de la Hb, observamos que por un proceso de duplicación génica el gen de la Hb dio lugar a la 
Hemoglobina α (HBA) y a la Hemoglobina β (HBB). Actualmente, 
conocemos la estructura tridimensional de la HBA1 para humano pero no para chimpancé (Pan troglodites). Modelización por homología 2 
Lo  que  vamos   a   hacer  en   este   tutorial   es   crear  la   estructura  tridimensional  de  la ...