Transcripción

Transcripción.

Para expresar la información del DNA se copian trozos, segmentos de información. Se trasncribe y la información del DNA pasa al RNA. Hay genes que se expresan en todas las células, son esenciales (constitutivos) y otros sólo se usan a veces. En organismos muy diferenciados hay genes que se expresan en unos sitios y en otros no, estando regulados a muchos niveles. Es importanteel nivel de transcripción, incidiendo en el enzima DNA polimerasa que une monómeros (ribonucleótidos) que forman el RNA cogiéndolos del entorno. Necesita ATP, CTP, GTP y UTP, nucleósidos trifosfatos en forma activada que hacen de molde). Como se han de unir en un orden necesita plantilla por lo que se llama DNA dependiente. Coloca ATP enfrente de timina y así con los otros. No necesita cebadorporque añade ribonucleótidos igual que DNA polimerasa en dirección 5’(3’ uniéndose al OH de nucleótido anterior. RNA tiene un extremo con fosfato y otro con OH. La cadena que copia es la codificante y el molde la complementaria.
Características importantes de los genes para la transcripción.
La polimerasa se une a una secuencia llamada promotor que normalmente está delante de la secuenciaque especifica el RNA. El primer nucleótido que está e el RNA (incluido en el promotor) es el +1 y todas las bases se toman desde ese punto de referencia, delante - y detrás +. El resto del promotor no se transcribe.
Procariotas: el promotor tiene dos zona comunes que son puntos de reconocimiento de polimerasa en las regiones -10 y -35. Esta secuencia de bases está bastante conservada:
Región-10: TATAAT
Región -35: TTGACA
La eficiencia de la transcripción depende de lo bien que reconozca la polimerasa al promotor, que pueden se diferentes en eficacia. Uno muy fuerte se transcribe muy rápido (1/ 2s) y otros menos fuertes más lentamente (1/10min). Cuanto más se parece el promotor a los anteriores más fuerte es. Las proteínas muy necesaria tienen genes con promotores fuertes. Haysecuencias reguladoras de polimerasas en el mismo promotor. Todos los genes tienen un sitio de término bien definido. En muchos casos en el sitio de término se forman estructuras secundarias, lo que depende de la proteína rho. A veces el mensaje es para varias cosas: RNA policistrónico. En u operón hay u promotor controlando la transcripción de varios genes juntos y al final hay una terminación comúnpara todos.
Eucariotas: Todos los genes tienen promotor y término. No hay policistrónicos. Con mucha frecuencia en los promotores se da una secuencia llamada caja TATA que está en la región -20. No hay zona en -35. Muchos genes tienen secuencias que pueden estar lejos de ellos para reactivar la transcripción (enhancers). Esto se logra porque una proteína (elementos trans) se une a una secuencia(elemento cis).:
- El mensaje está interrumpido por intrones que el RNA se pierden. Las terminaciones se pierden y aunque no se sabe bien para qué sirven parece que hay un procesamiento del RNA, El RNA se va muy lejos y otro enzima lo corta. Es muy común que muchos RNA mensajeros terminen en una cola común llamada poliA añadida por una endonucleasa posteriormente (no codificada). La cola sirvepara separarlos del resto.
Hay tres tipos de genes en eucariotas:
Familia 1: muy repetidos, codifican para RNA ribosómico. Son grandes y normalmente son precursores del que después se parte y da los distintos RNA.
Familia 2: mensajeros, cola poliA, intrones, exones ... Todo explicable. Muchos mensajeros distintos, sólo repetidos los de histonas.
Familia 3: codifican para tRNA y para unoribosómico pequeño (rRNA 55). A veces tienen promotores internos pero no en 5’.

RNA polimerasa DNA dependiente.
Lleva a cabo transcripción, necesita mole pero no cebador. Añade nucleósido trifosfato al OH del nucleótido anterior de manera que alarga en dirección 5’(3’ quedando pirofosfato que se hidroliza y desplaza la reacción. No puede corregir los errores que comete. Tasa de error 1/100.000....