alineamiento múltiple y diseño de primer

Páginas: 4 (941 palabras) Publicado: 3 de septiembre de 2014
Ejercicio 1: Obtenga las secuencias de proteínas con los siguientes números de acceso del NCBI:
AAA26690, P52600, P39886, P42670, Q00538.
>gi|153145|gb|AAA26690.1| ORF2 [Streptomyces coelicolor]MSSVEADEPDRATAPPSALLPEDGPGPDGTAAGPPPYARRWAALGVILGAEIMDLLDGTV-
MNVAAPAVRA
DLGGSLSVIQWITVGYTLAFAVLLVVGGRLGDIYGRKRMFVVGAVGFTAASVLCSVAAGP-
EMLTAARFLQGGLGALMIPQGLGLIKQMFPPKETAAAFGAFGPAIGLGAVLGPIVAGFLVDADLFGTGWR-
SVFLINLPIG
VAVIVGAVLLLPEGKAPVRPKFDVVGMALVTSGLTLLIFPLVQGRERGWPAWAFVLMLAG-
AAVLVGFVAH
ELRQERRGGATLIELSLLRRSRYAAGLAVALVFFTGVSGMSLLLALHLQIGLGFSPTRAA-
LTMTPWSVFLVVGAILTGAVLGSKFGRKALHGGLVVLALGVLIMLLTIGDQAGGLTSWELVPGIAVAGLG-
MGIMIGLLFD
IALADVDKQEAGTASGVLTAVQQLGFTVGVAVLGTLFFGLLGSQATASVDDGASRARTEL-
AAAGASTTEQ
DRLLADLRVCLRESASQQDSERTPDSCRNLQQARPAVAEATARAWRTAHTENFSTAMVRT-
LWVVIALLAVSFALAFRLPPKPREEEGF

>gi|1706646|sp|P52600.1|EMRY_ECOLI RecName: Full=Probable multidrug resistance protein EmrY
MAITKSTPAPLTGGTLWCVTIALSLATFMQMLDSTISNVAIPTISGFLGASTDEGTWVIT-
SFGVANAIAIPVTGRLAQRIGELRLFLLSVTFFSLSSLMCSLSTNLDVLIFFRVVQGLMAGPLIPLSQSL-
LLRNYPPEKR
TFALALWSMTVIIAPICGPILGGYICDNFSWGWIFLINVPMGIIVLTLCLTLLKGRETET-
SPVKMNLPGL
TLLVLGVGGLQIMLDKGRDLDWFNSSTIIILTVVSVISLISLVIWESTSENPILDLSLFK-SRNFTIGIVS
ITCAYLFYSGAIVLMPQLLQETMGYNAIWAGLAYAPIGIMPLLISPLIGRYGNKIDMRLL-
VTFSFLMYAV
CYYWRSVTFMPTIDFTGIILPQFFQGFAVACFFLPLTTISFSGLPDNKFANASSMSNFFR-
TLSGSVGTSLTMTLWGRRESLHHSQLTATIDQFNPVFNSSSQIMDKYYGSLSGVLNEINNEITQQSLSIS-
ANEIFRMAAI
AFILLTVLVWFAKPPFTAKGVG

>gi|730908|sp|P39886.1|TCMA_STRGA RecName: Full=Tetracenomycin C resistance and export proteinMSTETHDEPSGVAHTPASGLRGRPWPTLLAVAVGVMMVALDSTIVAIANPAIQQDLHASL-
ADVQWITNGY
LLALAVSLITAGKLGDRFGHRQTFLVGVAGFAVTSAAIGLSGSVAAIVVFRVLQGLFGAL-
MQPSALGLLR
VTFPPGKLNMAIGIWSGVVGASTAAGPIIGGLLVQHVGWEAVFFINVPVGLAALVAGLVI-
LTDARAERAPKSFDVSGIVLLSGAMFCLVWGLIKAPAWGWGDLRTLGFLAAAVLAFAGFTLRESRATEPL-
MPLAMFRSVP
LSAGTVLMVLMAFSFIGGLFFVTFYLQNVHGMSPVESGVHLLPLTGMMIVGAPVSGIVIS-
RFGPGGPLVV
GMLLTAASLWGMSTLEADSGMGITSLWFVLLGLGLAPVMVGTTDVIVSNAPAELAGVAGG-
LQQSAMQVGG...
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