Bacterias en citricos

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BACTERIAS PRESENTES EN EL SISTEMA VASCULAR DE ALGUNOS CÍTRICOS EN PUERTO RICO
Por Glenda Rivera Rodríguez Tesis sometida en cumplimiento parcial de los requisitos para el grado de MAESTRO EN CIENCIAS en Biología UNIVERSIDAD DE PUERTO RICO RECINTO UNIVERSITARIO DE MAYAGUEZ 2006

Aprobado por:

Mildred Zapata, Ph.D. Presidente, Comité Graduado

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Rafael Montalvo, Ph.D. Miembro, ComitéGraduado

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Carlos Ríos Velázquez, Ph.D. Miembro, Comité Graduado

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Félix Román Pérez, M.S. Miembro, Comité Graduado

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José L. Zamora M.S. Representante de Estudios Graduados

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Lucy Williams, Ph.D. Director del Departamento

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Abstract Citrus is one of the most important crops with the biggest global demand in the fruit industry. This crop has beenthe object of much research because of the variety of diseases that affect it; been the bacterial diseases the ones that limit significantly its production. During the past years, three of the endophytic bacteria have been reported, these bacteria live exclusively in the xylem. One of the bacteria restricting to the xylem, thus causing millions of dollars of losses in the citrus crop, is Xylellafastidiosa, which causes citrus variegated chlorosis. In Brazil, X. fastidiosa has been reported to be responsible for 100% of loss of the citrus crop. The purpose of this research is to describe the bacterial population presence in the vascular system of some important citrus in Puerto Rico. Bacteria were isolated in common and semiselective culture media in order to detect the presence ofbacteria in the vascular system. Eighty-six bacterial isolates from the vascular system were studied in regard to their morphology and some biochemical characteristics, and grouped into 11 strains. In citrus variety A-1 Ambersweet grafted in Swingle citrumelo rootstocks and B-3 Rhode red Valencia grafted in Cleopatra rootstocks, more bacteria were isolated compared to Hamlín variety D-2 Hamlín graftedin Carrizo rootstocks and D-4 Hamlín grafted in Sun chu sha rootstocks. By means of the BIOLOG® method, four bacteria strains were identified as: Bacillus sp. (two strains), Delftia acidovorans and Pseudomonas putida. Taxonomic positions were confirmed by using partial amplification and sequence of the gene 16S rRNA. The strains most frequently isolated were: Bacillus and Pseudomonas. Delftiaacidovorans and Pseudomonas putida were found to have potencial antagonisms toward some of the other bacteria under in vitro conditions.

ii

Resumen El cultivo de los cítricos es uno de los más importantes y con mayor demanda mundial en la industria de las frutas. Este cultivo está siendo objeto de numerosas investigaciones por las diversas enfermedades que lo afectan; siendo las enfermedadesbacterianas uno de los limitantes de mayor importancia en la producción. En los últimos años se han reportado tres bacterias endófitas que viven exclusivamente en el xilema. Una de las bacterias limitante de xilema, causante de millones de dólares en pérdidas en el cultivo de cítricos es, Xylella fastidiosa, causante de la clorosis de los cítricos variegada. En Brazil, X. fastidiosa ha sido reportadacomo la causante de hasta el 100% de pérdida del cultivo de cítricos. Este trabajo tiene como propósito describir las poblaciones bacterianas presentes en el sistema vascular de algunos cítricos de importancia en Puerto Rico. Se aislaron bacterias en medios de cultivos comunes y semiselectivos para detectar las bacterias presentes en el sistema vascular. Se agruparon 86 bacterias en 11 biotiposutilizando características morfológicas y bioquímicas. En las variedades de cítricos A-1 Ambersweet injertada en Swingle citrumelo y B-3 Rhode red valencia injertada en Cleopatra, se aislaron más bacterias al ser comparados con el cultivar Hamlín D-2 Hamlín injertada en Carrizo y D-4 Hamlín injertada en Sun chu sha. Mediante el método de BIOLOG® se identificaron cuatro biotipos bacterianos como:...
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