Bioquimica

Tema 1: Introducción a la Bioquímica
Introducción
La Bioquímica comienza con Friedrich Wohler (1800-1882) con la síntesis de urea a partir de cianato de amonio pasando por calor. Después viene Edurard Buchner (1860-1917) que a partir de extractos de levaduras muertas, consigue obtener la ruta de la glucolisis y fermentación anaerobia. A este le sigue James B. Sumner: que consigue cristalizarla ureasa, demostrando cristalizar la materia orgánica. Y por último Perutz: consigue la estructura de la hemoglobina.
¿Por qué la vida se basa en el Carbono?
El Carbono, el hidrogeno, el oxígeno y el nitrógeno componen el 99% del peso humano. Enlaces covalentes como unión básica para la vida. El carbono puede formar el mayor número de enlaces covalentes, es muy estable con una configuración C-Cy no es extremadamente fuerte con el enlace C-O para que se pueda degradar con facilidad aportando dinamismo en la forma de enlace
Macromoléculas
La naturaleza debe ser muy eficiente, para ello, constituye bloques (ladrillos) que se agrupan mediante condensación, produciendo macromoléculas.
Eucariotas vs Procariotas
Máxima diferencia: compartimentos capaces de aportar especialización. Sedescubre actualmente que en el núcleo interfasico se encuentra la cromatina ordenada una frente a otra, siguiendo un patrón, cosa que no sigue en las células cancerosas. Eso muestra la organización eficiente de cada molécula en la célula. Existen moléculas en las células que se usan como drogas antienferemdeades que bloquean la síntesis de ADN, la retro transcripción… Estas moléculas han sidosintetizadas con un razonamiento estructurado.
Tema 2: Agua, pH y Equilibrios Iónicos
No hay función sin estructura. ¿Cómo logran las macromoléculas permanecer con una estructura y con una función determinada?
Las moléculas tienen una secuencia lineal unida por enlaces covalentes pero las estructuras tridimensionales no se pueden apoyar por enlaces covalentes, por eso utilizan enlaces no covalentescomo puentes de hidrogeno entre diferentes bases nitrogenada.
Las histonas se asocian por interacciones electroestáticas, debido a sus diferencias entre cargas. Los enlaces no covalentes son 10 o 100 veces más débiles que los covalentes. Esta diferencia es necesaria, sobre todo para aportar dinamismo en la transcripción por ejemplo. Si estos enlaces no covalentes no existieran no se podría concebirvida.

Interacciones No Covalentes
Interacciones Carga-Carga (1/r) NO DIRECCIONAL
Es la interacción no covalente más sencilla, es la interacción electroestática entre moléculas de diferente carga. Cada partícula cargada que está separada en el espacio por una distancia R que ejerce una fuerza F dictada por la Ley de Coulomb en el vacío F= K* (q1*q2)/r2, la ley de coulomb en un determinadomedio, multiplica el denominador por épsilon donde épsilon es una constante dieléctrica para el medio. Si las cargas son iguales, la F será positiva.
Medios como el agua tienen una constante dieléctrica de E: 80 y otros como el etanol (orgánicos) E: 10-20, que crean un efecto de apantallamiento bloqueando interacciones de enlace entre moléculas e iones. El etanol tiene una constante dieléctrica querebaja el grado de apantallamiento dejando que el ADN reacciones con el Na creando facilidad para que se precipite. La energia de interaccion depende de la distancia que se expresa con el radio. Algunos ejemplos de interacciones carga-carga es la interaccion entre el grupo amino y el grupo carboxilo ya estemos hablando en terminos intermoleculares o intramoleculares.
Interaccion de DipolosPermanentes e Inducidos
Existen moleculas que no tienen carga neta pero que pueden tener una distribucion asimetrica de las cargas internas. Por ejemplo, el monoxido de carbono no tiene carga pero sabemos que su distribucion electronica en el oxigeno es mas electronegativo que en el Carbono. Esta molecula es considerada polar, o dipolo permanente, y se dice que tiene un momento dipolar permanennte...