Cromatografia En Columna

* Dominios de la misma familia tienden a tener mas o menos la misma estructura 3D y al tener 25% de la misma secuencia de amino acidos tiene un “fold” de la proteina igual en una region 0.2nanometro o 2 armstrong.
* “Evolutonary tracing” para identificar los sitios responsables de esa funcion del dominio. Todos esos amino acidos que no son cambiados durante la evolucion se mappean con unmodelo definitivo 3D.

* SH2 modulo que funciona en interacciones de proteina-proteina. La secuencia de amino acidos en el sitio de “binding” es la region que menos se a alterado en la evolucionpero las mutaciones puede afectar.

* 3D estructura, binding site y descifrar su funcion.

* Proteinas “bind” por interfases:
1. Surface-string: superficie de una proteina hacecontacto con un “string” de un polipeptido de una segunda prot.
Ej: el SH2 permite reconozer un polipeptido fosforalizado de otra proteina. Tambien permite a una proteina kinasa a reconocer lasproteinas cuales va a fosfolizar.
2. Helix-helix: forman un coiled-coil dos proteinas de alfa helice casi siempre son preoteinas reguladoras de genes. (gene regulatory proteins)
3.Surface-surface: la mas comun y la mas fuerte ya que permite formar muchos mas enlaces no covalentes que las otras interfases. Indica mucha especificidad ya que solo puede tener un solo partenr de proteinas contodos los miles que existen.
* Anticuerpos: “selective binding” son proteínas producidas por el sistema inmunológico a causa de moléculas que se encuentran en la superficie de un microorganismoque invadió el cuerpo.
* Anticuerpo: puede marcar una molécula para que se desactivada o desactivarla el mismo anticuerpo. El anticuerpo reconoce su target llamado antigeno con especificidad.* El antigen binding site del anticuerpo revela que esta formado de polipéptidos que protrude hacia fuera de un par cercano de dominio en yuxtaposición.
* Sin alterar su estructura basica los...