Familia de factores para la Transcripción

Familia de factores para la transcripción en eucariontes
Para poder hablar de estos factores, es necesario hablar de la ARN polimerasa 2, esta es la encargada de sintetizar a los ARN mensajeros y a casi todos los ARN pequeños nucleares (snARN Y snoARN).(Biología celular y Molecular, Geral Karp, Pag475)
La actividad de la ARN pol 2 requiere su interacción con unos complejos proteicosdenominados “Factores de transcripción”. (Conjugados oligonucleicos-peptido para el reconocimiento de factores de transcripción y adn; Cecilia Portela Pallares; USC; PAG12).
Dichos factores se pueden dividir en los siguientes 3 grupos. 1
Factores generales, necesarios para el comienzo de la síntesis de ARN a partir de todos los promotores de clase II (genes codificantes). Junto a la Pol ARN II forman uncomplejo alrededor del punto de inicio de la transcripción, y determinan en punto concreto de inicio de ésta; este complejo constituye el complejo de transcripción basal.
Factores corriente arriba,(upstream) o situados en son proteínas de unión al ADN que reconocen secuencias consenso cortas específicas situadas corriente arriba o en 5' (proximales) del punto de inicio de la transcripción (p.ej. Sp1, que se une a la caja GC). Estos factores son ubicuos y actúan sobre cualquier promotor que 5', contiene el lugar apropiado de unión al ADN. Su función es incrementar la eficiencia del comienzo de la transcripción.
Factores inducibles, que funcionan de manera semejante a los factores corriente arriba, pero con un papel más regulador. Se sintetizan o activan en momentos específicos entejidos determinados. Las secuencias a las que se unen se denominan elementos de respuesta.
Con esta pequeña introducción ya puedo empezar a hablar de las familias de factores de transcripción. (Diferentes factores de transcripción comparten ciertos tipos de motivos proteicos responsables de la unión al ADN y cuya presencia permite agrupar a estas proteínas en familias) las cuales las mencionare acontinuación.
1 Proteínas con hélice-giro-hélice (helix-turn-helix) 1
El motivo hélice-giro-hélice se identificó originalmente como un dominio de unión al ADN presente en represores de fagos; una hélice a se une al surco mayor del ADN, mientras que la otra descansa formando un ángulo a lo largo del ADN. Una forma relacionada con este dominio es la presente en el homeodominio, que fue inicialmentecaracterizada en varias proteínas codificadas por genes implicados en la regulación del desarrollo de Drosophila; y también está presente en genes que codifican para factores de transcripción humanos. La secuencia homeobox codifica para un dominio de 60 aminoácidos. El homeodominio es responsable de la unión al ADN y en éste radica la especificidad del reconocimiento al ADN. Su región C-terminalmuestra homología con el motivo hélice-giro-hélice de los represores de procariotas.
Imagen tomada del artículo “Expresión genética” Universidad Nacional del Nordeste, facultad de medicina, catedra biología.


2 Proteínas con dedo de zinc (zinc finger) 1
El motivo dedo de zinc es un motivo de unión al ADN. Inicialmente se encontró en el factor TFIIIA, necesario para que la Pol ARN IIItranscribe los genes del ARNr 5S. Las proteínas de este grupo toman su nombre de su estructura, en la que un grupo pequeño de aminoácidos conservados se unen a un ion de zinc. Existen dos tipos de proteínas de unión al ADN que tienen estructuras de este tipo: las "clásicas" proteínas con dedos de zinc y los receptores de esteroides.
Una "proteína dedo" generalmente tiene una serie de dedos de zinc; lasecuencia consenso de un solo dedo es:
Cys-X2-4-Cys-X3-Phe-X3-Leu-X2-His-X3-His
El motivo toma su nombre de uno de los tipos en los que salen del lugar de unión al zinc un bucle de aminoácidos


Las estructuras en dedo se suelen organizar como series individuales de repeticiones en tándem; la extensión de los dedos va desde las 9 repeticiones que ocupan prácticamente toda la proteína (como en...