Micologia

REVISIÓN

Diagnóstico micológico: algo está cambiando
Sergio Álvarez-Pérez, Marta Eulalia García y José Luis Blanco
Departamento de Sanidad Animal. Facultad de Veterinaria. Universidad Complutense. Madrid. España.

En los últimos años se ha realizado un gran esfuerzo por desarrollar distintas técnicas moleculares para el diagnóstico de laboratorio de las micosis. En este sentido, laelucidación de la secuencia genómica completa de los principales patógenos fúngicos representa una oportunidad sin precedentes para los micólogos clínicos. Existe, además, una gran expectación sobre la posible aplicación de los rápidos avances en el campo de la genómica y la proteómica al estudio de la base molecular de la patogenicidad fúngica, la búsqueda de nuevos antifúngicos más eficaces y laidentificación de antígenos fúngicos. En este artículo se revisan los principales hitos en la genómica de los hongos. Además, se presentan algunas aplicaciones de la genómica y la posgenómica de interés para el micólogo clínico. Palabras clave: Diagnóstico micológico. Genómica. Proteómica. Bioinformática.

Introducción
Las técnicas tradicionales de diagnóstico micológico se enfrentan con bastantefrecuencia a problemas de falta de especificidad, falta de sensibilidad, dificultades técnicas o de interpretación y lentitud1,2. El intento por solventar en la medida de lo posible dichos problemas ha sido un factor crucial para el desarrollo de las técnicas inmunológicas y moleculares. Por otro lado, hemos de situarnos en el contexto de las llamadas “-ómicas”, es decir, de las disciplinascientíficas que abordan su objeto de estudio de una manera global, como pueden ser la genómica, la proteómica, la metabolómica y otros campos afines. En la tabla 1 se presenta una relación de las principales “-ómicas” y su objeto de estudio. El desarrollo a gran escala de las técnicas de la genómica y posgenómica ofrece una oportunidad sin precedentes para investigar los caracteres asociados a lapatogenicidad de las especies fúngicas3. Además, existe una gran expectación sobre la posibilidad de aplicar dichos avances al diagnóstico de laboratorio de las micosis y al diseño de nuevas estrategias terapéuticas más eficaces. Hoy día, el micólogo clínico ya dispone de una amplia variedad de técnicas de diagnóstico molecular, cada una de las cuales es útil para determinar la identidad del agenteetiológico en una serie de niveles o rangos taxonómicos, pero pierde efectividad en otros aspectos. Es importante elegir bien la técnica que utilizar en función del uso que vayamos a hacer de ella: diagnóstico, epidemiológico o, simplemente, taxonómico. Las técnicas moleculares para la detección e identificación de hongos patógenos pueden dividirse en dos tipos4: a) Métodos de amplificación de señal, loscuales utilizan técnicas de hibridación de ácidos nucleicos. Las sondas de hibridación pueden utilizarse tanto para confirmar la identificación de un cultivo como para identificar el hongo patógeno en secciones tisulares. Estas sondas son utilizadas habitualmente para la identificación de patógenos como Histoplasma capsulatum y Coccidioides immitis. b) Métodos de amplificación de ácidos nucleicos,que se refieren fundamentalmente a todas las técnicas de reacción en cadena de la polimerasa (PCR). Hay desarrolladas técnicas de PCR para el diagnóstico de un gran número de micosis; por ejemplo, en nuestro laboratorio aplicamos de forma habitual estas técnicas para el diagnóstico de la aspergilosis y las dermatofitosis animales5,6. Por otro lado, debe considerarse el amplio abanico de técnicasdisponibles para la tipificación molecular de los aislamientos fúngicos: técnicas basadas en la utilización de endonucleasas de restricción, en la amplificación de secuencias al azar, en la detección de secuencias cortas repetidas en tándem a lo largo del genoma (minisatélites y

Mycological diagnosis: something is changing
Great effort has been made in recent years to develop molecular...