Transcripción

1. BIOSÍNTESIS DE PROTEÍNAS
La transcripción y traducción están acopladas en procarióticos. Una vez que el extremo 5’ queda libre el ribosoma empezará a interactuar con él. Mientras que en eucarióticos la transcripción y traducción están separadas. El ARNm se sintetiza en el núcleo y se transporta al citoplasma donde se lee.

2. TIPOS DE RNA POLIMERASAEN EUCARIÓTICOS
En eucariotas existen tres tipos de RNA-polimerasa.
La RNA polimerasa I se localiza en el nucléolo. Sintetiza RNA ribosómico con coeficientes de sedimentación: 5.8S, 18S, y 28S. No es inhibida por la α-amanitina.
La RNA polimerasa II se localiza en el nucleoplasma. Es responsable de la síntesis del RNA mensajero y pequeños RNA nucleares (snRNA). La α-amanitina la inhibefuertemente.
La RNA polimerasa III se localiza en el nucleoplasma. SInntetiza RNA transferente, RNA ribosómico 5S y otros RNA de pequeño tamaño. Es inhibida por la α-amanitina a altas concentraciones.

La α-amanitina es una de las toxinas más letales del grupo de las amatoxinas que se encuentra en hongos como la Amanita phalloides como vimos en la clase anterior.
TRANSCRIPCIÓN DE RNAs RIBOSÓMICOS ENEUCARIOTAS
En la transcripción, la RNA-pol I genera un precursor de dos genes consecutivos y cada uno contiene la información para sintetizar rRNA. En eucariotas, el ribosoma es de 80 S y sus subunidades son de 40 S y 60 S. La subunidad 60 S está formada por precursores de 5.8 S, 28 S y 5 S que se unen a 50 proteínas. La subunidad 40S, está formada por precursores de 18 S que se une a 30proteínas ribosomales.

El promotor está formado por un elemento iniciador y un elemento upstream.
3. FORMACIÓN DEL COMPLEJO DE TRANSCRIPCIÓN DE LA RNA POLIMERASA II
El ensamblaje del complejo de transcripción de la RNA polimerasa II tiene lugar alrededor de la caja TATA, donde se van montando una serie de elementos.
1. El primero es complejo factor de transcripción IID o TFIID (el II es por lapolimerasa II y la D porque hay distintos factores que se unen) que engloba TFIID y la proteína TATA box binding protein, también llamada TBP, que se une a la caja TATA y abraza el DNA como si de una silla de montar se tratara. ). Hay otros factores asociados denominados TAF, que se asocian a TFIID. Cada vez van ensamblándose más elementos siguiendo un orden, y de esta manera no se podrá unir unelemento al complejo si no se ha unido el anterior.
2. Después se añadirían el TFIIB y el TFIIA.
3. A continuación, se unen RNA polimerasa II y TFIIF. La TFIIF se une a TFIIB e impide la unión de la RNA polimerasa II a secuencias de DNA inespecíficas.
4. Los últimos en unirse serían el TFIIE y el TFIIH que actúa como helicasa desenrollando la cadena para el inicio de la transcripción. Ademásla THFIIH va a fosforilar la región carboxilo terminal (llamada CTD) de la RNA polimerasa II. El desenrollamiento y la fosforilación actúan como señal de inicio de la transcripción.

4. ELEMENTOS TÍPICOS DE DETERMINADOS PROMOTORES
Los promotores son regiones del ADN que regulan la transcripción. Interaccionan con proteínas que funcionarán como potenciadores (aumentando los niveles detranscripción) o como silenciadores. Por tanto, puede haber un control positivo de la transcripción o un control negativo.
En la siguiente imagen vemos diferentes promotores, como el promotor SV40 que contiene múltiples cajas; otro que contiene una caja GC; o un último que posee un elemento que permite da inicio a la transcripción si se produce una situación de estrés.

5. mRNA EN EUCARIÓTICOS
El RNAmensajero después de la transcripción sufre una serie de modificaciones antes de ejercer su función. Estas son la adición del CAP o casquete y la poliadenización.
A. ADICIÓN DEL CASQUETE (CAP) AL EXTREMO 5’
Consiste en la unión en el extremo 5’ del RNA de un nucleótido, el 7-metil-guanosina, conocido como casquete o “cap”. La adición se produce por medio de la enzima guanicil transferesa...