Trasposones

Secuencias conservadas
Son secuencias de ADN que tienen capacidad de motilidad. Estas secuencias son:
* Trasposones: es una secuencia de ADN que puede moverse de manera autosuficiente a diferentes partes del genoma de una célula, un fenómeno conocido como transposición. En este proceso, se pueden causar mutaciones y cambio en la cantidad de ADN del genoma. Anteriormente fueron conocidos como"genes saltarines" y son ejemplos de elementos genéticos móviles.
El transposón modifica el ADN de sus inmediaciones, ya sea arrastrando un gen codificador de un cromosoma a otro, rompiéndolo por la mitad o haciendo que desaparezca del todo. En algunas especies, la mayor parte del ADN basura (hasta un 50% del total del genoma) corresponde a transposones.
A diferencia de los provirus, lostransposones se integran en el ADN celular en lugares bien determinados.
* Secuencias de inserción (IS): son elementos transponibles caracterizados por ser más pequeños que los trasposones (entre 720 y 2000pb de longitud), sólo codifican proteínas implicadas en la transposición. Éstas suelen ser la transposasa, que permite el movimiento de la IS, y una proteína reguladora que permite o inhibe latransposición. La región codificante es complementaria e inversa. Esta secuencia es:
---------------------ATGCA------------------
---------------------TACGT-------------------
La trasposasa se encarga de cortar la secuencia de ADN y luego ligarla en otro lugar.
Su mecanismo de acción es:
* La trasposasa corta el plásmido A que posee el Trasposón. Lo corta por el extremo 3’ que posee el grupo–OH. Luego, actúa sobre el plásmido B, dejando libre el grupo P del extremo 5’.
* Luego se produce el proceso de la trasposición, en la que se unen ambos plásmidos. Al unirlos, aparecen espacios que quedan sin nucleótidos. Éstos se rellenan por el propio mecanismo de la célula.
* Por último, se produce la trasposición replicativa. En ella, el Trasposón queda integrado en el plásmido A yen el plásmido B.
En ocasiones puede ocurrir la trasposición no replicativa, en la que el Trasposón queda integrado únicamente en un plásmido, no en los dos.

Hay trasposones que provienen de virus. Son los denominados retrovirus. Se caracterizan por poseer la transcriptasa inversa. Ésta, a partir del ARN vírico, hace una copia en ADN.
Estos virus poseen dos cadenas de ARN como materialgenético. Éste es necesario para la síntesis de proteínas virales. El retrovirus, infecta a la bacteria, e introduce su material genético. Es en este momento, cuando se activa la transcriptasa inversa, que replica ese ARN en ADN de doble cadena. Posteriormente, este ADN se integra en el de la bacteria, se replican con él, y codifica a proteínas virales. Este es el mecanismo por el cual, los retrovirusconsigue replicarse.
Este genoma viral integrado en el de la bacteria recibe el nombre de provirus. Cuando este material integrado, puede pasar a las células hijas de la bacteria, recibe el nombre de provirus endógeno.
El genoma de los retrovirus, contiene en sus dos extremos, las secuencias LTR. Estas secuencias son fundamentales para la maquinaria de este genoma. Luego, entre ambas secuencias,se localizan todos los genes que codifican a las proteínas necesarias para el virus.
El mecanismo de integración del genoma viral en el bacteriano consiste en que la integrasa, enzima del virus, corta el genoma viral por las dos secuencia LTR, y ella misma liga ese segmento en el genoma bacteriano.
Tipos de secuencias de ADN
clase | familias | Nº copias | % que ocupan del genoma |
LINE (ADNdisperso) | 123 | 600·103370·10344·104 | 17.33.30.3 |
SINE ( secuencias cortas de elementos nucleares interdispersos) | Alu (enzima de restricción del Arthrobacter luleus)MirMir3 | 1.2·106450·10385·103 | 210.72.50.4 |
Elementos LTR | ERV: elemento retroviralMALTR | 240·107288·103 | 4.73.8 |
Trasposones ADN | MER1: charlieMER2: tigger | 213·10760·103 | 30.4 |

Son copias de secuencias...