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Tema 4: Secuenciación del
ADN (1)
Lectura del ADN de los organismos

Bioinformática Básica
Autor: Dr. Oswaldo Trelles- Universidad de Málaga
Número de créditos: 4
Área de conocimiento UNESCO: 24- Ciencias de la vida

Proyecto OpenCourseWare- UNIA> Bioinformática Básica. Dr. Oswaldo Trelles

Introducción

El genoma o secuencia completa de ADN
de un organismo constituye lainformación
genética heredable del núcleo celular, los
plásmidos, la mitocondria y cloroplastos.
Secuenciar es determinar el orden en que
se enlazan las bases de dicha secuencia.
Los tremendos avances de las técnicas de
secuenciación del ADN permiten hoy en día
leer el ADN a gran velocidad lo que ha
llevado a abordar proyectos a gran escala
como el Proyecto Genoma Humano. Pero
además sedispone ya de la secuencia
completa de ADN de muchos genomas de
animales, plantas y microorganismos.
Proyecto OpenCourseWare- UNIA> Bioinformática Básica. Dr. Oswaldo Trelles

Definiciones (1)
El genoma es el material genético almacenado
en cada una de las células de un organismo.
El término “secuencia” designa la composición
de nucleótidos de un trozo de ADN o la de
aminoácidos de unaproteína. Ese trozo de ADN
puede corresponder a un gen, un genoma, o a
una parte de ellos.
Como verbo, “secuenciar” es determinar la
estructura de una secuencia de ADN, es decir, el
tipo y orden de sus nucleótidos.
Todos los organismos vivos están compuestos de células, y
cada una de ellas contiene toda la dotación genética (ADN)
del organismo. Para obtener el genoma basta secuenciar
unasola copia del ADN, que en el caso humano es de unos
3.400 millones de bases. Al ser de doble hebra se dice
pares de bases (bp).

Curiosidades: El ADN es una molécula muy larga, que se enrolla en el
interior de los microorganismos y núcleos celulares. Un adulto humano
tiene aprox. entre 10 y 50 billones de células (1000'000'000'000) Si se
desenrollara y pusieran en fila los cromosomas encada una de ellas la
longitud total del ADN sería de unos 2 metros. Si se sumara la longitud
del ADN de todas las células de una sola persona se podría rodear la
circunferencia terrestre 500,000 veces.
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Definiciones (2)
Un plasmido, es una pieza de ADN, pequeña y circular que se
encuentra frecuentemente en bacterias.Esta molécula, debido a los
genes que porta, puede por ejemplo ayudar a la bacteria a
sobrevivir en presencia de un antibiótico.
Los plásmidos son importantes porque se pueden (1) aislar en grandes
cantidades, (2) cortar, dividir e insertarles cualquier pieza de ADN, (3)
devolverlo nuevamente a la bacteria donde se replicarán junto con el ADN
nativo y (4) ser aislados nuevamente,obteniéndose billones de copias del
ADN que se les insertó. Su tamaño varía entre los 2.5 y las 20 Kb

BAC es el acrónimo de “Bacterial Artificial Chromosome” y en principio se
usa como los plásmidos, pudiendo construir BAC que porten ADN
humano, de ratón, etc., e insertarlos en una bacteria que hace de
hospedaje. Al igual que con los plásmidos, al proliferar la bacteria también
se replican los BACs.En este caso se trata de entre 100 a 400 kb que
pueden ser replicadas fácilmente usando BACs y ésta ha sido una de las
formas en que se ha clonado grandes porciones del genoma humano

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Recombinación del ADN
Las técnicas de recombinación del ADN permiten transferir parte
de ADN de un organismo (normalmente el que seestá estudiando)
a otro más simple de manipular y reproducir, como una bacteria. Al
reproducirse la bacteria se reproduce el trozo de ADN en estudio
que luego se puede volver a separar (con lo que se tienen grandes
cantidades de ADN) y estudiar en detalle.
Para secuenciar necesitamos una buena cantidad de ADN, por lo que es necesario
hacer muchas copias del mismo. Para ellos se usan...