bioquimico diagnostico

UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓMA DE MÉXICO.

FACULTAD DE ESTUDIOS SUPERIORES CUAUTITLÁN-CAMPO 1

EJERCICIOS ENBI-GENBANK

Licenciatura: Bioquímica Diagnóstica.

Asignatura: BioinformáticaProfesora: Maritere Domínguez

Alumna: Serralde Mendoza Laura A.

Gpo: 2001











EJERCICIO 1 - Realiza la búsqueda de la secuencia nucleotídica de la subunidad B de la toxinaproducida por Vibrio cholerae en la base de datos europea reportando las características esenciales de esta.
Tipo de molécula: unassigned DNA
Clase de datos: Registro de patente (PAT)
Longitud dela secuencia: 444 bps.
Secuencia:
CDS: 1 que codifica para la subunidad B de la toxina cólera.
Longitud de CDS: 131 aa.
Secuencia de CDS:

EJERCICIO 3- Usted está trabajando con la rs3748816variación de la secuencia. Éste es un SNP, ubicado en el gen MMEL1 en humanos. El gen codifica para una metaloproteasa que rompe polipéptidos preferentemente entre los residuos hidrófobos.Determina las características de este gen.
Organismo: Homo sapiens
Tipo de molecula: mRNA
Longitud de secuencia:1869 bps
Secuencia:


CDS: 1 que codifica para la proteína MMEL1.
Longitud de CDS:779 aa.
Secuencia:


EJERCICIO 4 - Proporciona las funciones de la insulina humana, así como las anotaciones de su secuencia.
Función de la insulina: Participa en la regulación del metabolismode hidratos de carbono (en particular glucosa) y grasas.
Características: Comúnmente considerada como una proteína, que consiste en dos cadenas peptídicas, una que contiene 21 residuos deaminoácidos y otra que contiene 30; las cadenas están unidas por 2 puentes disulfuro.
Secuencia:

EJERCICIO 5 - Realiza una traducción de la siguiente secuencia empleando una herramienta proporcionadapor EBI.
ATGCTCAGCGCCCAGGAGCGCGCCCAAATCGCGCAGGTCTGGGACCTGATTGCGGGCCAC
GAGGCGCAATTCGGGGCGGAGCTGCTGCTCAGGCTCTTCACGGTGTACCCCAGCACCAAG
GTCTACTTCCCGCACCTGAGCGCCTGCCAGGACGCGACGCAGCTGCTGAGCCACGGGCAG...