Biorremediacion

Escuela de Ingeniería en Bioinformática
Facultad de Ingeniería
Universidad de Talca

Proyecto 2: Bases de
Datos Avanzadas
Integrantes:

María Joaquina Beltrán Leiva
Isabel FuenzalidaValdivia

Carrera:

Ingeniería en Bioinformática

Profesor:

Juan Fica

Asignatura:

Bases de datos avanzadas

Fecha de entrega:

19/06/13

1. Introducción

El software presentado,corresponde a BioMDB (Biological Meta-Data Base). Este
sistema consiste en un sitio web que tiene como objetivo almacenar información
relevante perteneciente a bases de datos biológicas; Datos comoarquitectura, tipo y
descripción son asignados en base a una clasificación previa.
El sistema recibe un archivo de extensión xml y registra los datos contenidos en
una base de datos relacionalimplementada en PostreSQL a través de un parseo realizado
en php. Adicionalmente se genera un servicio web descrito a través de WSDL que
proporciona información referente a los campos almacenados en la tablaque guarda las
bases de datos. Así, el usuario puede cargar un documento con la información a
almacenar y posteriormente visualizar el detalle del archivo usado (nombre, tamaño, etc.)
y de losregistros insertados por tabla, además de acceder al servicio web para ver los
campos de las bases de datos en detalle.

1) Archivo XML





KEGG


Relacional




Primaria


Muchasmuchas




PDB



Secundaria


Muchas




PDBe


OO



Muchas





QSAR


Mixta




Terciaria


Casi nada




2) DTD3) Schema






Nodo 1 Campo 'descripción' vacío Nodo
2 Nodo 3 Nodo 4




















Subelemento 'arquitectura'
vacíoSubelemento 'tipo'
vacío

























4) Modelo físico

En el modelo físico se puede observar con más detalle la base de datos. Esta última,
está compuesta por...