Biotecnologia Verde

Taxonomía de la familia Halobacteriaceae:
un paradigma para el cambio de conceptos en procariotas
sistemática
Aharon Oren
Departamento de Botánica y Ciencias del Ambiente, el Instituto de Ciencias de la Vida, y Moshé el
Shilo Minerva Center por Marine Conservación Biogeoquímica de la Universidad Hebrea de Jerusalén,
91904 Jerusalén, Israel
El arqueas halófilas dela Halobacteriaceae familia (36 géneroscon 129 especies con pie en la nomenclatura a partir de noviembre de 2011) proporciona un ejemplo excelente de cómo el cambio de conceptos
sobre la taxonomía procariota y el desarrollo de nuevos métodos han influido en la forma en que la taxonomía de un solo grupo de procariotas se trata. Esta revisión ofrece una visión general de la taxonomía de la familiaHalobacteriaceae, mostrando el impacto que los métodos de fenotípica
la caracterización, la taxonomía numérica, quimio taxonomía y análisis de los lípidos polares, en especial 16S
rRNA comparaciones de secuencias de genes, análisis de tipo de multilocus y genómica comparativa ha tenido
en su clasificación.
introducción
Cuando en 1972, Helge Larsen (1922-2005) tuvo el honor de
ofrecer el AJ Kluyver conferenciaconmemorativa antes de la
Países Bajos, la Sociedad de Microbiología, que escogió como su título:
'El halobacterias de la confusión a la biología ". Esta intrigante
título era una paráfrasis de la contribución de los microbios para
biología ", el famoso título de una serie de conferencias a cargo de Albert
Jan Kluyver y Cornelis van Niel. En el momento sólo dos
géneros y tres especies fueronreconocidas dentro de la familia
Halobacteriaceae (un nombre oficial publicado dos años
más tarde, Gibbons, 1974), y conceptos tales como 16S rRNA
basado en genes filogenia y las propiedades especiales del
Archaea aún no se conocían. Sin embargo, ya era claro que las
halobacterias eran fundamentalmente diferentes de los otros
conocida como procariotas carecen de una pared celular depeptidoglicano,
requieren altas concentraciones de sal para el crecimiento y estructural
estabilidad y tienen una pigmentación inusual (Larsen,
1973).
Los primeros representantes de la familia eran Halobacteriaceae
más aislado que hace cien años, y en la actualidad
(Noviembre de 2011) la familia comprende 36 géneros con
129 especies (Arahal y col., 2011 y actualizaciones posteriores).la
secuenciascompletas del genoma de al menos 12 especies han sido
publicada y se espera que sea liberado pronto.
El Halobacteriaceae familia son un excelente grupo para ilustrar
cómo los conceptos de la taxonomía procariota, la clasificación
y la nomenclatura ha cambiado, el nombre del género
Halobacterium se introdujo formalmente en 1957 (Elazari-
Volcani, 1957). Los métodos de taxonomía numérica,quimio taxonomía,
filogenia molecular, la secuencia de multilocus
análisis (MTAS) y la genómica comparativa, han tenido un
impacto en la manera en que actualmente mira la taxonomía de este
grupo. No todos los problemas de clasificación se han resuelto todavía,
e ideas sobre la taxonomía de la familia son Halobacteriaceae
en constante cambio. Esta revisión presenta una visión general de cómonuestros conceptos sobre la taxonomía de estas muy interesantes
arqueas halófilas han cambiado a lo largo de los años.
Las primeras descripciones de color rojo muy halófilas
procariotas
Las primeras descripciones de forma de varilla, rojo yextremadamente
procariotas halófilos fecha a partir de 1919 cuando HenrichKlebahn
describe 'Bacillus halobius ruber'. Estudio de la Klebahn
"Losagentes dañinos del klippfish 'se puso recientemente a disposición
en una traducción al Inglés preparado en colaboración con
descendientes del autor (DasSarma et al., 2010). Poco después,
Harrison y Kennedy (1922) aislada 'Pseudomonas salinaria'
de la coloración roja de bacalao curado. La cepa tipo de
Halococcus morrhuae fue aislado en 1880 por Farlow, y esto
especie se encuentra en la...