clase 1

Microbiología Ambiental
BIO 151E
Carolina Serrano, PhD

Microbiología ambiental

Ecología microbiana
El estudio de las interacciones
entre los microorganismos y su
ambiente (químico, físicoy
biológico!).
1. Conocer la biodiversidad de
los microorganismos en la
naturaleza
2. Conocer las actividades de
los microorganismos en la
naturaleza

Microbiología ambiental
• Elementosde
Ecología microbiana.
• Diversidad
microbiana.
• Biofilms.
• Microorganismos en
la descontaminación
ambiental.
• Tratamientos de
efluentes
• Biorremediación.
• Biolixiviación
.Cuántos microorganismos se conocen en relación a los otros organismos
que existen en la Naturaleza?

Diversidad biológica conocida
Microorganismos
(156 k)

plantas
(270 k)

animales
(1.230 k)ecosistemas
34

micro
organismos
200 k

existente

conocido

microbios

plantas
250 k
animales
1500 k

plantas
animales

• Especies bacterianas descritas:
5.000
• Especiesbacterianas supuestas:
100.000 - 3.000.000

pero

hombre

Cultivabilidad :
0.1% - 0.001%

Las bacterias viven en el ambiente formando
microcolonias, Biofilms

Técnicas cultivodependientes

Medios de cultivo
líquidos y sólidos

Cultivos de enriquecimiento

“todo está en todas partes…” M. Beijerinck

Anomalías del conteo en placa

Viables y
cultivables

Conteo enPlacas

Viables
cultivables y
no cultivables

Conteo directo

Cultivo v/s No cultivo
• Al tratar de aislar
microorganismos se pierde
una alta cantidad de
información debido a los noaislables
• Los organismos aislados
pueden no ser
ecológicamente relevantes
• Muchos microorganismos
tienen tiempos
generacionales
extremadamente largos.

Técnicas cultivo independiente
Beneficios• No es necesario aislar al microorganismo
• Permite el análisis de comunidades microbianas
complejas
• Permite el análisis de gran cantidad de muestras
a la vez
• Buena reproducibilidad...