ECOLOGIA MICROBIANA

ECOLOGÍA MICROBIANA
• Análisis de comunidades microbianas basadas en
técnicas de cultivo.
• Análisis molecular de las comunidades microbianas.
• Medición de la actividad microbiana en la naturaleza.

Dra. Flor Teresa García Huamán
Dra. Flor Teresa García Huamán

1

La ecología microbiana trata de la interacción de los
microorganismos
entre
sí
y
su
ambiente.
Los ecólogos microbianos se dedicanprincipalmente a dos áreas de
estudio.

La bidiversidad
• Qué incluye el aislamiento, identificación y cuantificación
de microorganismos en hábitats diversos.

La actividad microbiana
• Es decir, lo que los microorganismos hacen en sus
hábitats.

Dra. Flor Teresa García Huamán

2

La ecología microbiana tiene dos grandes objetivos:
• Apreciar la biodiversidad de los microorganismos
y entender lainteracción entre los diferentes
grupos que componen la comunidad.

• Medir la actividad de los microorganismos en la
naturaleza y controlar sus efectos en el
ecosistema.

Dra. Flor Teresa García Huamán

3

I. ANÁLISIS DE LAS COMUNIDADES
MICROBIANAS BASADOS EN TÉCNICAS DE
CULTIVO
Este proceso consiste en separar los organismos de
interés de una comunidad microbiana, un
procedimiento
que
se
conocecomo
ENRIQUECIMIENTO, y que permite aislarlos después en
un cultivo axénico. El aislamiento es importante por
que se obtienen cultivos para estudios detallados y
controlados de laboratorio y para su aplicación en
biotecnología y microbiología ambiental e industrial.
Dra. Flor Teresa García Huamán

4

ENRIQUECIMIENTO Y AISLAMIENTO
En un ambiente natural no es frecuente encontrar un solo tipo
demicroorganismo. Lo que existe son comunidades microbianas,
y el desarrollo de métodos y procedimientos que permitan el
aislamiento y cultivo de microorganismos interés es un reto para
el ecólogo microbiano.
El enfoque más corriente para alcanzar este propósito es la
TECNICA DEL CULTIVO DE ENRIQUECIMIENTO.

Dra. Flor Teresa García Huamán

5

TÉCNICA DEL CULTIVO DE ENRIQUECIMIENTO
Este método requiereque el medio de cultivo y las condiciones
de incubación sean selectivos para el organismo que se desea
aislar y contra selectivos para los organismos no deseados.
Por tanto se necesita reproducir lo más fielmente posible los
recursos y las condiciones que se dan en este nicho ecológico y
buscar luego los habitantes potenciales de aquel hábitat
capaces de desarrollarse en las condiciones deenriquecimiento
seleccionadas.

Dra. Flor Teresa García Huamán

6

Para que un cultivo de enriquecimiento tenga éxito es
necesario contar con un inóculo apropiado (una
muestra que contenga el microorganismo). Por tanto, la
metodología del cultivo de enriquecimiento se inicia
con la elección del hábitat adecuado.
El cultivo de enriquecimiento suele establecerse
sembrando el inóculo directamente en unmedio
altamente selectivo; muchos de los procariotas más
frecuentes pueden aislarse de esta manera.

Dra. Flor Teresa García Huamán

7

Por ejemplo, el microbiólogo holándes Martinus Beijerink, a quien se
deben las primeras técnicas de cultivo de enriquecimiento, aisló por
primera vez la bacteria fijadora de nitrógeno Azotobacter por medio
de lo que después se convirtió en una estrategia clásicade
enriquecimiento.

Como Azotobacter puede crecer rápidamente fijando N2 del aire,
los medios de enriquecimiento carentes de amoniaco u otras
formas de nitrógeno fijado son muy selectivos para este
organismo; las bacterias no fijadoras de nitrógeno o las bacterias
fijadoras de nitrógeno anaeróbicas son contra seleccionadas con
este método.

Dra. Flor Teresa García Huamán

8

Tanto el medio decultivo como las condiciones de
incubación son críticos para que tenga éxito un cultivo
de enriquecimiento; es decir deben optimizarse tanto
los recursos como las condiciones para tener las
mejores posibilidades de enriquecer el microorganismo
que interesa.

Dra. Flor Teresa García Huamán

9

LA COLUMNA DE WINOGRADSKY
Tradicionalmente, la columna de Winogradsky se ha utilizado en
el cultivo de...