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El pensamiento de Aquino partía de la superioridad de las verdades de la fe, sin embargo, ello no le impidió presentar a la filosofía como un modo de conocimiento plenamente autónomo capaz de por unlado, concordar armónicamente con la teología, y por el otro, de tratar de forma independiente los más diversos aspectos de la realidad.
Se puede analizar su pensamiento de acuerdo a dos etapas:* Primera (1245–1259). En este período predominan las influencias de Platón (Avicena y Alberto Magno) y las neoplatónicas (Agustín de Hipona y el Pseudo Dionisio).
Entre las obras más importantes deesta etapa podemos destacar: los comentarios a las obras de Pedro Lombardo, Boecio (Sobre la Trinidad), el opúsculo titulado De ente et essentia y el libro primero de la Suma contra Gentiles. Lafunción de esta obra era servir de apoyo a los predicadores que tenían que discutir con judíos y musulmanes, valiéndose de argumentos racionales y filosóficos sin tener que basarse sólo en la fe.
*Segunda (1259–1273). Sin cambiar su pensamiento precedente, domina en el filósofo el pensamiento aristotélico, logrando una síntesis entre platonismo y aristotelismo. Así comenta ampliamente la Ética aNicómaco.
* San Agustín fue formado en el cristianismo, pero luego atraído por el maniqueísmo. Según esta doctrina fundada por Maní existían dos principios: la Luz equiparada el Bien o Dios y laOscuridad equiparada al Mal o Materia. Ambos eran eternos y originaban el tiempo.

Luego, San Agustín, gracias al neoplatonismo, vuelve al cristianismo.
Su doctrina era la Iluminación divina, según lacual sólo el alma racional puede alcanzar esas ideas ejemplares y eternas, así se da el “sentido íntimo” que integra las dos verdades: las que vienen del alma y las que llegan al alma desde Dios.Entonces, la Iluminación es posible cuando el hombre se aleja del mal.
Para San Agustín, el hombre ético es aquel que se guía por la fe y no solo con la razón.
 
Sus dos obras más importantes...