estudio genético del lago titicaca

ESTUDIO GENÉTICO DE LAS ESPECIES ÍCTICAS
NATIVAS DEL LAGO TITICACA.
CARACTERIZACIÓN Y ESTRUCTURA
POBLACIONAL
INFORME FINAL

Adolfo de Sostoa
Ignacio Doadrio
Claudia Patricia Ornelas
Nuno Caiola
Carlos Pedraza
Orieta Flores
Mario Monroy
Alberto Maceda
Febrero 2010

PERÚ Ministerio

de la Producción

Despacho Viceministerial
de Pesquería

ESTUDIO GENÉTICO DE LAS ESPECIESÍCTICAS
NATIVAS DEL LAGO TITICACA.
CARACTERIZACIÓN Y ESTRUCTURA
POBLACIONAL

Dr. Adolfo de Sostoa
Lic. Mario Monroy
Lic. Alberto Maceda
Dp. Biología Animal. Facultad de Biología.
Universidad de Barcelona.

Dr. Ignacio Doadrio
Lic. Claudia Patricia Ornelas-García
Lic. Carlos Pedraza-Lara
Museo Nacional de Ciencias Naturales
Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC)

Dra.Orieta Flores
Proyecto Especial Binacional Lago Titicaca (PELT)
Puno

Dr. Nuno A. Caiola
Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries (IRTA)
Generalitat de Catalunya

Con la colaboración de:
Proyecto Especial Binacional Lago Titicaca (PELT)
Autoridad Binacional Autónoma del Lago Titicaca (ALT)

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ÍNDICE
1. Introducción ……………………………………………………………………………………..1
1.1.Antecedentes…………………………………………………………………………………..1
1.2. Objetivos………………………………………………………………………………….........7
1.2.1. Objetivos generales…………………………………………………………………………7
1.2.2. Objetivos específicos……………………………………………………………………….7
1.2.2.1. Caracterización genética de las especies nativas del lago Titicaca………………...7
1.2.2.2. Caracterización y estructura poblacional………………………………………………8
1.3. Estaciones demuestreo……………………………………………………….....................9
2. Estudio genético de las especies ícticas nativas del lago Titicaca………………………..12
2.1. Introducción…………………………………………………………………………………...13
2.1.1.Situación geográfica………………………………………………………………………..13
2.1.2.Diversidad íctica del altiplano……………………………………………………………...15
2.1.3.Ictiofauna presente en el lago Titicaca..………………………………………………….16
2.1.4. Relaciones filogenéticas de las especies del género Orestias………………………...242.2. Objetivos……………………………………………………….............................................27
2.2.1. Objetivos generales………………………………………………………………………...27
2.2.2. Objetivos específicos……………………………………………………………………… 27
2.3. Métodos……………………………………………………………………............................28
2.3.1. Colecta de material biológico………………...……………………………………………28
2.3.2. Extracción de ADN y amplificación de genesmitocondriales y un gen nuclear……...31
2.3.3. Análisis de los datos ……………………………………………………………………….32
2.3.4. Análisis de clados anidados……………………………………………………………….33
2.3.5. Datación de la cladogénesis con reloj molecular relajado. …………………………….34
2.3.6. Redes haplotípicas………………………………………………………………………….35
2.4. Resultados y discusión……………………………………………………………………….36
2.4.1. Caracterización molecular del géneroOrestias………………………………………….36
2.4.1.1. Especies estudiadas del género Orestias en el lago Titicaca………………………..39
2.4.1.2. Análisis filogenéticos del género Orestias basado en la secuencia del Cytb……….81
2.4.1.3. Análisis filogenéticos del género Orestias basado en la secuencia de tres genes
Cytb,D-LOOP y Rho (2,851pb)…….……………………………………………………………83
2.4.1.4. Evidencia genética de hibridación entrediferentes especies de Orestias..………...89
2.4.1.5. Híbridos dentro del género Orestias…………………………………………………….91
2.4.1.5.1. Identificación de haploptipos nucleares………………………………………………91
2.4.1.6. Redes de haplotipos del Cytb y su correspondencia morfológica y geográfica…...104
2.4.1.7. Datación molecular de la cladogénesis dentro del género Orestias………………..108
2.4.2. Caracterización molecular delgénero Trichomycterus…………………………………110
2.4.2.1. Análisis filogenéticos del género Trichomycterus basado en la secuencia del gen
Cytb ………………………………………………………………………………………..111
2.4.2.2. Implicaciones filogenéticas del género Trichomycterus en el lago Titicaca………..113
2.4.2.3. Implicaciones taxonómicas respecto al género Trichomycterus en el lago...