Factores de traducción directa la dinámica intrínseca del ribosoma durante la terminación de la traducción y el reciclaje del ribosoma.

Factores de traducción directa la dinámica intrínseca del ribosoma
durante la terminación de la traducción y el reciclaje del ribosoma.

La caracterización de la dinámica estructural del ribosoma traduce sigue siendo un objetivo importante en el estudio de la síntesis de proteínas.
Desacilación del peptidil-tRNAen el alargamiento de traducción provoca fluctuaciones del complejo ribosomalpretranslocation
entre dos estados de conformación global. Factor de elongación G-mediada por el control de la conformación dinámica resultante
equilibrio ayuda a coordinar los movimientos de los ribosomas y ARNt durante la elongación y es por tanto una característica crucial de la mecánica
traducción. Más allá de elongación, desacilación del peptidil-tRNA también ocurre durante la terminación dela traducción, y esto desacilada tRNA
persiste durante el reciclaje del ribosoma. Aquí mostramos que la regulaciónespecífica del equilibrio conformacional análoga
liberación de traducción y los factores de reciclaje del ribosoma tiene un papel fundamental en los mecanismos de terminación y el reciclaje. nuestros resultados
la opinión de que la regulación específica de la situación mundial de losribosomases una característica fundamental de toda la traducción
factores y un tema unificador a través de la síntesis de proteínas.

Ribosoma, el ARNt y la traducción reordenamientos factor estructural son
la hipótesis de que tienen importantes funciones mecánicas a lo largo de la proteína
síntesis. Algunos de los más caracterizados de conformación
los cambios de la maquinaria detraducción incluyen los movimientos de
ARNt de sus clásicos para su híbrido configuraciones de unión al ribosoma,
movimiento del tallo ribosomal L1 de un proceso abierto a una
conformación cerrada, y el giro a la izquierda, o de trinquete,
de la pequeña (30S) subunidad ribosomal en relación con el grande (50S)
subunit1-7. El uso de un tallo L1-tRNA de una sola molécula para ·rster resonanciatransferencia de energía (smFRETL1-tRNA) de la señal, hemos demostrado
que los movimientos estocásticos del tallo de la L1 entre abierto y cerrado
conformaciones dentro de un complejo pretranslocation elongación ribosomal
se acoplan a las fluctuaciones de la P-tRNA sitio entre los clásicos
e híbridos configurations8. Junto con intersubunit conjunto
FRET datos de la correlación de lo clásico y lohíbrido tRNA vinculante
configuraciones con las conformaciones nonratcheted y trinquete de
ribosomal subunits9, respectivamente, nuestros smFRETL1-tRNA datos sugieren
que el complejo entero de forma espontánea y pretranslocation
reversible oscila entre dos grandes estados conformacionales: global
el estado 1 (GS1) y el estado global 2 (GS2) 8 (Fig. 1a).
Las características esenciales de nuestromodelo dinámico han sido recientemente
en gran medida validada. Los estudios de los complejos smFRET pretranslocationhan
informó intersubunit espontánea y reversible de rotación entre
dos conformaciones importantes, nonratcheted y ratcheted10, así como
las fluctuaciones del tallo de la L1 entre abierto y cerrado conformations11
(J.F y R.L.G., datos no publicados). En conjunto, estos estudiosrevelaron
que las constantes de equilibrio que rigen la nonratcheted # trinquete
ribosoma y abierta # cerrado L1 tallo equilibrios están estrechamente correlated11,
reforzando la idea de que estos procesos dinámicos están acoplados.

De acuerdo con este modelo, dos recientes estudios de la crio-ME de clasificación utilizados
métodos para revelar la existencia de ambos GS1 y GS2 como-conformaciones en un solo pretranslocation sample6, 7, sin ningún tipo de
intermedios detectable. Sin embargo, nuestro modelo GS1 GS2 # duda
no incorporar toda la complejidad dinámica que abarca una
B2.5-MDA biomolecular de la máquina. Además, es perfectamente
posible que los de corta duración y / o intermediarios rara vez se han muestreado
hasta ahora eludido su detección por medio de...