Genética

1)Descripción del método
Para comenzar se obtuvo la secuencia del gen 16S ARNr de las siguientes bacterias presentes en el suelo: Escherichia coli, Uncultured Salmonella sp., Aphanocapsa feldmani,Synechococcus, Phormidium sp., Agromonas oligotrophica, Bradyrhizobium elkanii strain, Bradyrhizobium betae, Bradyrhizobium japonicum, Mycoplana bullata, Hoeflea alexandrii, Mesorhizobium temperatum,Rhizobium daejeonense, Rhizobium leguminosarum.
Con el programa ClustalW se realizó un análisis de similitud de las mismas obteniéndose el siguiente dendrograma:
Luego se eligieron dosmicroorganismos cercanos: Aphanocapsa feldmani y Phormidium sp. sobre el gen 16S ARNr de este último se realizaron distintas modificaciones y se observo como éstas afectaban la similitud entre ambas bacterias. Parallevar a cabo esta comparación, se obtuvo un nuevo dendrograma con estas 2 bacterias y 6 más: Escherichia coli, Uncultured Salmonella sp., Synechococcus, Agromonas oligotrophica, Bradyrhizobiumbetae, Mycoplana bullata.

A continuación se detallan las modificaciones producidas sobre el gen 16S ARNr de Phormidium sp. con sus respectivos dendrogramas y conclusiones.

a) Mutación puntual en elnucleótido 480 (se cambio el nucleótido G por C):

No cambió la composición del cluster, lo único que se modificó fueron las distancias pero no de forma significativa. Esto se debe a que lasmutaciones puntuales no suelen tener gran incidencia.

b) Deleción de 10pb en zona de alta homología (delción de nucleótidos 1011 a 1020):

No se observan cambios en el grupo original, debido a que elprograma pudo haberlo interpretado como un gap, conservándose las zonas de homología.

c) Deleción de 100pb en zona de alta homología (delción de los nucleótidos 956 a 1055):

Se observa un cambio enla cercanía entre Phormidium sp. y Aphanocapsa feldmani debido a que se eliminó la zona más larga de alta homología entre ellas. Cambios en secuencias de alta homología pueden generar cambios...