hidrobiologica

Hidrobiológica
Universidad Autónoma Metropolitana - Iztapalapa
rehb@xanum.uam.mx

ISSN (Versión impresa): 0188-8897
MÉXICO

2005
Efraín de Luna / José A. Guerrero / Tania Chew Taracena
SISTEMÁTICA BIOLÓGICA: AVANCES Y DIRECCIONES EN LA TEORÍA Y LOS
MÉTODOS DE LA RECONSTRUCCIÓN FILOGENÉTICA
Hidrobiológica, diciembre, año/vol. 15, número 003
Universidad Autónoma Metropolitana -Iztapalapa
Distrito Federal, México
pp. 351-370

Red de Revistas Científicas de América Latina y el Caribe, España y Portugal
Universidad Autónoma del Estado de México

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11/11/05

6:25 PM

Página 351

Hidrobiológica 15 (3): 351-370

ARTÍCULO DE REVISIÓN

Diciembre 2005

Sistemática biológica: avances y direcciones en la teoría y los métodos de la reconstrucciónfilogenética
Systematic biology: advances and directions in theory and methods of phylogenetic reconstruction
José A.
1

Guerrero2

Efrain De Luna1,
y Tania Chew-Taracena3

Departamento de Biodiversidad y Sistemática, Instituto de Ecología AC. Apdo. Postal 63, Xalapa, Ver. CP 91000. México. deluna@ecologia.edu.mx
2
Laboratorio de Sistemática y Morfología, Facultad de Ciencias Biológicas, UAEM,Cuernavaca, Mor. CP 62210. México.
3
Posgrado en Sistemática, Instituto de Ecología AC. Apdo. Postal 63, Xalapa, Ver. CP 91000. México.

De Luna E., J. A. Guerrero y T. C. Taracena. 2005. Sistemática biológica: avances y direcciones en la teoría y los métodos de la reconstrucción filogenética. Hidrobiológica 15 (3): 351-370.

RESUMEN
Se examinan los conceptos de parsimonia, verosimilitud yprobabilidad posterior, los cuales son centrales a los
métodos alternativos para la selección de topologías óptimas en la reconstrucción filogenética. La tendencia a
la complejidad y sofisticación matemática de la descripción del espacio de los árboles y de los métodos de
exploración basados en parsimonia y en probabilidades (máxima verosimilitud y Bayesianas) señala que los
requerimientoseducativos demandarán una base ineludible de conocimientos en filosofía de la ciencia, teoría y
métodos estadísticos y biología molecular. Esta educación será necesaria para poder entender la operación de
los diversos métodos disponibles, pero sobre todo, para poder visualizar sus bases teóricas y decidir
críticamente cual de las opciones usar en las distintas fases de la investigación taxonómica. Laimportancia de
la necesidad de tal uso informado de métodos se revela en la tendencia a usar los métodos de parsimonia y
probabilísticos (máxima verosimilitud y métodos Bayesianos) sin explorar las implicaciones epistemológicas de
tales enfoques en la reconstrucción filogenética. Indudablemente, el interés en los métodos de reconstrucción
filogenética esta en expansión; por lo tanto, esimportante que los biólogos filogenéticos consideren
cuidadosamente las bases epistemológicas y la relevancia de los métodos que usan en la selección de
topologías óptimas.
Palabras clave: Epistemologia, modelos, parsimonia, verosimilitud, bayesianos.

ABSTRACT
We examine the concepts of parsimony, likelihood and posterior probability, which are central to alternative
methods for selectingoptimal topologies in phylogenetic reconstruction. Complexity and mathematical
sophistication of the description of the space of trees and of exploration methods based on parsimony,
likelihoods and Bayesian posterior probabilities points to educational requirements demanding an unavoidable
knowledge base in the philosophy of science, statistical theory and methods, and molecular biology. Such highereducation becomes necessary in order to understand the operation of diverse available methods, but most
importantly, to be able to discern their theoretical basis and to critically decide which option to use in different
aspects of taxonomic research. Importance of the need of an informed use of methods becomes evident in the
tendency to use either parsimony or probabilistic methods...