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Selección chilena de fútbol [editar]
Tras su exitoso paso por Universidad de Chile, el 3 de diciembre de 2012 fue presentado oficialmente como nuevo director técnico de la Selección de fútbol deChile, con el desafío principal de lograr la clasificación al Mundial de Brasil 2014.
El mismo día viajó a Europa con el objetivo de conversar con varias figuras chilenas, entre los que sedestacan Claudio Bravo, Fabián Orellana, Arturo Vidal y David Pizarro, este último con el fin de convencerlo a regresar a su selección. El intento fue infructuoso, ya que el "fantasista" manifestó posteriormentesu negativa a jugar nuevamente por el Seleccionado Chileno.
También intentaría volver a contar con los servicios de Jorge Valdivia, marginado de la selección en el proceso anterior (quedirigió Claudio Borghi) en el conocido caso "Bautizazo".
El 15 de enero de 2013 dirigió su primer partido por la Selección de fútbol de Chile con una victoria por 2-1 frente a Senegal en el Estadio La Portada de LaSerena, logrando así, debutar con el "pie" derecho en el nuevo proceso de la selección, a diferencia de los procesos anteriores de Claudio Borghi y Marcelo Bielsa, quienes se estrenaron con un empatey una derrota, respectivamente.
El 19 de enero de dicho año gana su segundo partido al mando del seleccionado chileno frente a Haití por 3 goles a 0 en un partido disputado en el Estadio Municipal deConcepción. Cabe destacar que en estos dos últimos partidos la composición de "La roja" fue solo de jugadores del plano local, ya que al no tratarse de "Fecha FIFA", el estratega solo pudo disponerde los jugadores que disputan la Liga Chilena.
Su primer partido fuera de Chile con la Selección Chilena fue contra la selección de Egipto el 6 de febrero. Se disputó en el Estadio Vicente Calderón dela ciudad española de Madrid, con triunfo chileno por 2-1, siendo el primer partido en el que Sampaoli pudo contar con jugadores que militan en clubes extranjeros como Claudio Bravo, Gary...