Introduccion a la bioinformatica

Introducción a la Bioinformática
Centro de Bioinformática Instituto de Biotecnología Universidad Nacional de Colombia Andrés M. Pinzón cPhD - Universidad de los Andes

7'000.000 de habitantesCapital Mundial del Libro 2007

2600m sobre el nivel del mar

“Actualmente en Biología el número de datos es mucho mayor a la capacidad de análisis del investigador”.
1958 Primera secuencia deuna proteína (insulina. Sanger, Premio Nobel)1 1975 Primera secuencia de ADN (fago PHI-X174 Sanger, Nobel 1980 )

1986 desarrollo de PCR ... inicio de la era genómica!! 1http://www.genetics.org/cgi/content/full/162/2/527

BD para las ciencias de la vida

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DNA Proteínas Genómicas Dominios/familias protéicas Mutación/polimorfismo Proteómica (2D gel, MS) 3D estructuraMetabolismo Bibliografía SNPs, ESTs, Microsatélites, etc..

Algunas estadísticas
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Más de 1000 bases de datos Generalmente accesibles vía WEB ● Biohunt: http://www.expasy.org/BioHunt/ ● Amos’links: www.expasy.ch/alinks.html Tamaño variable: 100Kb a 100Gb ● DNA (EMBL): > 68 Gb (comprimida!) ● 80,591,891 entradas. ● 146,595,277,574 nucleótidos.

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Crecimiento de la base datos EMBL engigabases.

Crecimiento de la base datos EMBL en millones de entradas.

Sin embargo...
Tenemos las secuencias pero... ¿Como podemos saber qué partes de ese DNA controlan los diversos procesosquímicos de la vida? Conocemos la función y estructura de algunas proteínas pero... Cómo determinamos nuevas funciones? Como predecir la conformación espacial de una proteína, basados únicamente en susecuencia? Entendemos el código genético pero... Como encontrar nuevas palabras significativas que podamos añadir al diccionario del DNA?

BIOINFORMÁTICA
Biología Computacional Aplicación detécnicas analíticas y cuantitativas para el modelamiento de sistemas biológicos. "La bioinformática comprende los métodos matemáticos, estadísticos y computacionales que pretenden solucionar problemas...