magnesio y zinc como cofactores en la replicacion

Magnesio como cofactor de replicacion
ADN pol es un holoenzima. Esta requiere un co-factor, un ión de Magnesio, para funcionar correctamente. Sin el ión de Magnesio, esta enzima esta sólo un apoenzima.

Un "holoenzima" esta o la forma completa y activa de una enzima con múltiples subunidades o la combinación de un apoenzima con su cofactor.

Un apoenzima es una enzima sin su cofactor o sinsus múltiples subunidades. Para las ADN pols, el cofactor es el ión de magnesio.

En la reacción catalizada por ADN pol, los cebadores y el ADN quelatan el ión de magnesio. Entonces la concentración de este ión tiene que ser medida para cada reacción. A veces, hay que añadir el ion magnesium
Zinc como cofactor de replicación
Los dedos de cinc son pequeños motivos estructurales de proteínas quepueden coordinar uno o más iones de cinc para ayudar a estabilizar sus pliegues. Se pueden clasificar en diferentes familias estructurales y normalmente funcionan como módulos de interacción que unen el ADN, ARN, proteínas y moléculas pequeñas. El nombre de "dedo de cinc" fue acuñado para describir la hipótesis de la estructura de la unidad repetida del factor de transcripción IIIA en Xenopuslaevis.
Los dedos de cinc coordinan iones de cinc con una combinación de residuos de cisteína e histidina. Pueden ser clasificados por el tipo y orden de estos residuos de coordinación con el cinc (por ejemplo, Cys2His2, Cys4, y Cys6). Un método más sistemático los clasifica en distintos "grupos de pliegues" basado en la forma de la columna de la proteína en el dominio plegado. El "grupo de pliegues"más común de dedos de cinc es el de tipo Cys2His2 (el "clásico dedo de cinc"), clave triple y cinta de cinc.1
Índice
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• 1 Dedos de cinc Cis2His2
• 2 Dedos de cinc Zn2/Cis6
• 3 Matrices de dedos de cinc prediseñadas
• 4 Ensamblaje modular
• 5 Métodos de selección
• 6 Posible aplicación en terapia molecular
• 7 Referencias
• 8 Enlaces externos
Dedos de cinc Cis2His2[editar]El grupo de plegamiento tipo Cis2His2 es la clase de dedos de cinc mejor caracterizados y son muy comunes en factores de transcripción de mamíferos. Estos dominios adoptan un pliegue ββα y tienen el siguiente motivo de secuencia aminoacídica: X2-Cis-X2,4-Cis-X12-His-X3,4,5-His 2 Esta clase de dedos de cinc puede tener una variedad de funciones tales como la unión a ARN y lasinteraccionesproteína-proteína, pero es mejor conocido por su papel en la unión a secuencia específica de ADN, en proteínas como Zif268. En estas, los dominios de dedos de cinc se suceden típicamente en repeticiones en tándem con dos, tres o más dedos por el dominio de unión a ADN por proteína. Estos arreglos en tándem se pueden unir al surco mayor del ADN y están normalmente espaciados a intervalos de 3 pares de bases.La α-hélice de cada dominio (a menudo llamada la "hélice de reconocimiento") puede hacer contactos con secuencias específica de bases de ADN; los residuos de una sola hélice de reconocimiento puede contactarse con 4 o más bases para producir un patrón de superposición de contactos con los dedos de cinc adyacente.
Dedos de cinc Zn2/Cis6[editar]
Los miembros de esta clase contiene complejos decinc binuclear en donde dos iones de cinc están unidos a seis residuos decisteína. Estos dedos de cinc se pueden encontrar en varios factores de transcripción incluyendo la proteína Gal4 de la levadura.
Matrices de dedos de cinc prediseñadas[editar]
Diversas estrategias se han desarrollado para el diseño de dedos de cinc Cys2His2 que se unan a las secuencias deseadas. Estas incluyen "ensamblajemodular" y estrategias de selección que emplean, ya sea expresión de fagos o sistemas de selección celular. Tales arreglos de dedos de cinc prediseñados pueden ser utilizado en numerosas aplicaciones, tales como factores de transcripción artificiales, metilasas de dedo de cinc,recombinasas de dedo de cinc y nucleasas con dedos de zinc.3 Factores de transcripción artificiales con matrices de dedos...