Metagenómica

REVISTA INTERNACIONAL DE BOTÁNICA EXPERIMENTAL
INTERNATIONAL JOURNAL OF EXPERIMENTAL BOTANY
FUNDACION ROMULO RAGGIO
Gaspar Campos 861, 1638 Vicente López (BA), Argentina
www.revistaphyton.fund-romuloraggio.org.ar

Metagenómica de suelos: grandes desafíos y nuevas oportunidades biotecnológicas
Soil Metagenomics: new challenges and biotechnological opportunities
Hernández-León R, IVelázquez-Sepúlveda, MC Orozco-Mosqueda, G Santoyo
Resumen. El suelo es un sistema complejo que alberga una gran
cantidad y diversidad de microorganismos. Hasta hace poco, sólo se
podía tener acceso al estudio de un pequeño porcentaje de la microbiota que habita en este ecosistema. Actualmente, con la metagenómica se ha logrado conocer y estudiar en más detalle todo ese material genómico desconocido. Sehan descubierto nuevas moléculas con
aplicaciones biotecnológicas y se ha profundizado en entender mejor
las diferentes interacciones microbiológicas en diversos ambientes,
algunos con características extremas. En este ensayo se analizaron los
trabajos más recientes en el área de la metagenómica, con énfasis en
aquellos relacionados con el suelo. Asimismo, se describen los logros
alcanzadospor el proyecto Metacontrol (metagenómica de suelos
supresores de enfermedades), y finalmente, proponemos los diferentes desafíos que ha de superar la metagenómica, así como las nuevas
oportunidades biotecnológicas que surgen con esta nueva ciencia.
Palabras clave: Metagenómica; Suelo; Microorganismos.

Abstract. Soil is a complex system that includes a great number
and diversity ofmicroorganisms. Until recently, only a small percentage of the bioma was known and could be studied. Currently, it is
possible to have a deeper knowledge of all that unknown genomic
material with the development of new tools, like metagenomics. New
molecules have been discovered with various biotechnological applications, and knowledge of the diverse microbiological interactions
in severalenvironments, some of them with extreme life conditions,
is much higher. We analyze the most recent literature in the field
of metagenomics in this study, especially that related with the soil.
Achievements of the Metacontrol project (metagenomics of diseasesuppressive soils) are also described. We finally propose various challenges to be overcome in metagenomics, and new biotechnological
opportunitiesemerging with this new science.
Keywords: Metagenomics; Soil; Microorganisms.

Laboratorio de Recombinación y Diversidad Genómica, Instituto de Investigaciones Químico Biológicas, Universidad Michoacana de San Nicolás de Hidalgo. Ciudad Universitaria,
Edificio A1´, Morelia, Michoacán, México. C.P. 58030.
Address Correspondence to: Dr. Gustavo Santoyo, e-mail: gustavo_santoyo@yahoo.com;gsantoyo@umich.mx
Recibido / Received 21.V.2010.Aceptado / Accepted 17.VIII.2010.
FYTON ISSN 0031 9457, (2010) 79: 133-139

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INTRODUCCIÓN
La metagenómica es una ciencia que surge como una rama
de las ciencias genómicas, la cual se refiere al estudio del metagenoma de un nicho en particular (Handelsman, 2004; Riesenfeld et al., 2004). El metagenoma se puede definir como el
total de ADN deuna muestra ambiental. Hasta el momento,
se han investigado metagenomas de diversos ambientes, incluyendo ecosistemas acuáticos, minas, suelos agrícolas y forestales, entre otros (Rondon et al., 2000; Wang et al., 2000;
Lee et al., 2004; Tyson et al., 2004; Craig et al., 2009). Lo
relevante de estos estudios es que cada uno de ellos ha mostrado diferentes aspectos para estudiar y analizar. Enalgunos
casos, se han descubierto novedosos elementos genéticos que
podrían tener aplicación en la industria (Rondon et al., 2000;
Wang et al., 2009), mientras que en otros, han aportado novedosos aspectos de la ecología microbiana en un ecosistema en
particular (Tyson et al., 2004).
Mediante técnicas convencionales de cultivo en laboratorio
se ha estudiado la diversidad microbiana y sus...