proyecto encode

Proyecto ENCODE

ENCODE es el acrónimo de “ENcyclopedia Of DNA Elements”, y se trata de un proyecto de análisis exhaustivo para identificar los elementos funcionales y secuencia del genoma humano,que comenzó con un proyecto piloto en Septiembre 2003.
El objetivo era identificar un conjunto de aproximaciones que permitan la tipificación exhaustiva de todos los elementos funcionales en elgenoma humano. A través de la piloto ENCODE, NHGRI evaluaron las capacidades de los diferentes enfoques para ser ampliados para analizar la totalidad del genoma humano y de encontrar elementos funcionalesen la secuencia genómica.

OBJETIVOS-RESULTADOS

Área
Meta
Logro
Fecha
Mapa Genético
2-5 cM (resolution map /600-1500 markers)


1cM (resolution map 3000 markers)

Sept 1994
MapaFísico
30,000 STSs

52,000 STSs

Oct 1998
Secuencia DNA
95% de gen que contiene parte de la secuencia humana.
Terminado a 99,99% de precisión
Abr 2003
Capacidad y costo de la secuencia finalSecuencia 500Mb /$0.25 por base terminada
>1,400Mb/año a $0.9 por base terminada
Nov 2002
Variación en secuencia humana
10,000 SNPs humanos mapeados
3.7 millones de SNPs humanos mapeados
Feb 2003Identificación de gen
cDNAs humanos longitud completa
15,000 cDNAs humanos longitud completa
Mar 2003
Organismos modelos
Genoma completo de sequences of E. coli, S .cerevisiae, C. elegans, D.melanogaster
Secuencia de genomas completos mas otros incluyendo
C. briggsae, D. pseudoobscura, ratón y rata

Abr 2003
Análisis funcional
Tecnología de escala genómica desarrollada
Síntesis deADN oligonucleótidos de alto rendimiento Eucariotas.
Genoma completo de levaduras
Ampliación de sistema de dos híbridos de la interacción proteína-proteína.
1994


1996

1999
2002PARTICIPANTES
El proyecto de genoma humano se logró con la participación de diversos institutos internacionales. En Estados Unidos de América contribuyeron; National Institutes of Health (NIH), the U.S....