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Ubicado entre los Departamentos del Beni (provincia de Moxos) y de Cochabamba (provincia Chapare). Los municipios involucrados son San Ignacio de Moxos y Loreto en el Beni, yVilla Tunari y Morochata en Cochabamba. Tiene una superficie aproximada de 12.000 km2. Desde 1990, tiene el doble estatus de Área protegida y territorio Comunitario de Origen (TCO).Colinda con otras TCOs: Yuracaré y Yuqui al Este, Territorio Indígena Chimán y Territorio Indígena Multiétnico al Norte y es vecino a la TCO Mosetén al Oeste. Alberga una grandiversidad biológica, con más de 600 especies de aves. Existen sitios arqueológicos de gran interés histórico. El clima varía según el gradiente latitudinal desde templado a frío enlas partes altas hasta cálido en las tierras bajas.

El rango altitudinal oscila entre los 3.000 msnm, con una altura promedio de 300 a 400 msnm. Presenta una variadafisiografía debido a su ubicación transicional entre las Serranías Subandinas y los Llanos de Moxos. La parte Sur y Oeste del Área es esencialmente montañosa y de abruptas pendientes eincluye las Serranías de Mosetenes y Sejeruma como contra fuertes del subandino. Las regiones Central y Sur están definidas por el relieve casi plano de la llanura aluvial de Moxos. Seregistraron 402 especies de flora y se estima la existencia de 3.000 especies de plantas superiores. La extraordinaria diversidad florística incluye especies como el aliso, pinode monte, nogal, cedro, mara, palo maría y el tajibo. Se registraron 714 especies de fauna. Destacan: el jucumari, pejichi, marimono, manechi, londra, jaguar, ciervo de lospantanos, harpía, pato negro, peta de río, el caimán negro y aves endémicas. El TIPNIS se caracteriza por una importante población de los grupos étnicos Moxeño, Yuracaré y Chimán.