Web semántica y linked data

ISSI-IST-G-2

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La Web Semántica y Linked Data en la investigación biomédica
Pablo Sauras Pérez Alumno IES, MUI-TIC 2010-2011

Resumen—El presente documento trata de dar una visión de la Web Semántica y Linked Data, tecnologías que forman lo que se conoce como Web 3.0, la evolución de la Web 2.0. Asimismo, se plantea la utilidad de estas tecnologías como ayuda para la investigaciónbiomédica, en la que distintos organismos unen su conocimiento en favor de dicha investigación. Así se verá, a través de un ejemplo como es el proyecto Bio2RDF, cómo los propios principios de la Web Semántica y Linked Data hacen posible la integración de dicho conocimiento. Además, dicho proyecto hace uso del concepto de mashups semánticos, con lo que se pone de manifiesto que la Web 3.0 trata deaprovechar también conceptos de la Web 2.0. Palabras clave— Web Semántica, Linked Data, Web 3.0, RDF, Ontología, Bio2RDF.

trabajo que tratan de aprovechar el concepto de Web Semántica para publicar y compartir sus datos. Así, hoy en día podemos encontrar aplicaciones de la Web Semántica y Linked Data en sectores tan dispares como el entretenimiento [8] o las administraciones públicas y el gobierno[9] [10]. Por otra parte, dentro del plan de estudios del Máster en Investigación en Tecnologías de la Información y las Comunicaciones que estamos cursando, se estudia la Web Semántica en las asignaturas Tecnologías Emergentes en Sistemas Telemáticos [11][12] y Aplicaciones Basadas en Servicios de Información [13] pertenecientes a los Módulos de Especialización en Ingeniería de SistemasTelemáticos ,y de Especialización en Ingeniería de Sistemas y Servicios Informáticos, respectivamente. De la misma manera, en el marco de la asignatura para la que se presenta este documento (Introducción a las Especialidades), [14] introdujo la necesidad de la existencia de la Web Semántica como respuesta a ciertos “vacíos” que generaba la Web 2.0. Por otra parte [15], estudiaba la utilidad del uso de laWeb Semántica y Linked Data en el contexto educativo. En este documento nos centraremos en el estudio de la Web Semántica y Linked Data como medio para la investigación biomédica. ¿Es posible que las características de la Web Semántica y Linked Data favorezcan y faciliten la investigación biomédica? Una rápida navegación en la Web de W3C Semantic Web Activity [1] nos lleva a comprobar laexistencia de un grupo de trabajo (Semantic Web Health Care and Life Science (HCLS) Interest Group [16]) que centra sus estudios en el uso de la Web Semántica como medio para favorecer la investigación biológica y médica. De la misma forma, un amplio sector de la Nube de Linked Data [17] (en continuo crecimiento), está dedicado a esta parte de la ciencia. Además, la revista Journal of BiomedicalInformatics dedicó un número especial al estudio del uso de las tecnologías de la Web Semántica para la integración de los datos dentro del ámbito de la salud y las ciencias de la vida (life science) [18]. Uno de los artículos de ese número especial describe el proyecto Bio2RDF [19], que tiene como objetivo la

I. INTRODUCCIÓN Web Semántica es la Web de datos [1]. La mayor parte del contenido delWorld Wide Web, tal y como lo conocemos, está basado en documentos diseñados para ser interpretados y leídos por humanos, y no por las propias máquinas. La Web Semántica trata de conseguir una estructura común de datos para que los mismos puedan ser interpretados de forma automática por las propias máquinas (machine-readable), aún perteneciendo a diferentes fuentes. De esta forma, la Web Semántica sepreocupa más del significado de los datos presentados, que de su propia representación al usuario [2] y pretende conseguir una “gran base de datos común”. Por otra parte, al igual que en la Web comúnmente conocida la navegación a través de los contenidos de la misma se realiza a través de hyperlinks, la tecnología que permite la publicación y navegación a través de los datos pertenecientes a...