Aminoacids i proteïnes

TEMA 1: INTRODUCCIÓ A L’ESTUDI
1. TIPUS DE BIOMOLÈCULES
− Proteïnes: molècules molt complexes que desenvolupen activitats especialitzades. Algunes
proteïnes s’ocupen del manteniment de l’estructura física de les cèl·lules. Unes altres realitzen
funcions de transport (com l’hemoglobina).
− Glúcids: són els també anomenats “hidrats de carboni” o “sucres”. Es tracta de substàncies
que fan lafunció de combustible cel·lular. Els glúcids són la principal font d’energia química
dels organismes vius.
− Lípids: també anomenats greixos. Estan formats per carboni, hidrogen i oxigen. La seua
funció biològica és la de proveir de reserves d’energia els organismes.
− Àcids nucleics: són les molècules que contenen la informació que fa que els organismes
s’assemblen als seus progenitors, oinformació genètica.
− Vitamines: imprescindibles per a que els éssers vius pugen desenvolupar moltes de les reaccions bioquímiques del metabolisme.
2.ENLLAÇOS I INTERACCIONS FEBLES
-Enllaç d’hidrogen:
Per optimitzar-lo, l’angle ha de ser de 180.
Han d’estar a prop: 2A
Enllaç fort de tipus dipol-dipol
Es forma entra un enllaç polar i un àtom electronegatiu (N-H, O-H, F-H)
-Enllaç iònic(forces electrostàtiques)
Unió d'ions de signe oposat per atracció electrostàtica i sempre ve format per un metall (catió) i un no metall (anió).
Les substàncies que hi intervenen constitueixen xarxes cristal·lines iòniques formades per un gran nombre d'anions i cations.
L'enllaç iònic només es forma quan la diferència d'electronegativitat és elevada

-Interaccions de Van der Walls
Ladistancia ha de ser de 3A
-Força hidrofòbica
Tendeixen a la màxima entropia.
La molècula orgànica no polar s’acaba solvatant amb una altra molècula hidrofòbica (alliberant aigua).

3. CARACTERÍSTIQUES COMUNES
-Cooperativitat
-Proximitat


TEMA 2: LES PROTEÏNES
1.ELS AMINOÀCIDS

ESTRUCTURA I FUNCIÓ
Els aminoàcids són molècules que contenen un grup amino, un grup carboxil i una cadenalateral que varia entre els diferents aminoàcids. Els elements bàsics d'un aminoàcid són el carboni, l'hidrogen, l'oxigen i el nitrogen.
Els aminoàcids són crítics per a la vida i tenen moltes funcions en el metabolisme. Una funció molt important és que serveixen com a blocs de construcció de les proteïnes, que són llargues cadenes lineals d'aminoàcids. Hi ha 22 aminoàcids que són incorporats de maneranatural a polipèptids. D'aquests, 20 són codificats pel codi genètic universal. Hi ha nou aminoàcids que s'anomenen “essencials” per als humans, ja que no poden ser sintetitzats a partir d'altres compostos pel cos humà.
L’aminoàcid més senzill és la glicina (gly).






PROPIETAT DELS AMINOÀCIDS
SEls aminoàcids presenten esteroisomerica: tenen un carbón asimètric. Quan una molécula és laimatge oposada o especular de l’altre, es pot superposar.
Els esteroisòmers són aquells compostos que tenen un o més C asimètrics.
Per saber si la imatge òptica és S o R:
Clockwise R: sentit de les agulles del rellotge.Només ho és la cys.
Counterclockwise S: semtit invers. Dels 20 aminoàcids, 18 ho són. (la gly no és res).

La cadena lateral (R) li dóna propietats diferencials als aminoàcidsque es traduïran en diferències estructurals i funcionals segons si:
Polars o apolars
Àcids o bases
Grans o petits


ÀCIDS O BASES
Recordar que:
Els àcids cedeixen protons
Les bases capten protons
Un medi molt àcid es trova protonat. Quan anem pujant el Ph, el grup àcid carboxilat comença a cedir protons.
Quan ph =7, el COOH ha cedit totalment l’H.


Si volem saber la proporció queestà desprotonada, cal aplicar la fórmula de Henderson Hasselbach. El pk ens indica la força de l’àcid, és a dir, en quin momento estarà la meitat protonada i l’altre desprotonada.


R-COOH R-COO– + H+
R-NH3+  R-NH2 + H+

En les proteïnes:
El Pk més àcid és alfa carboxil (3,1)
El pk més bàsic és arginina (12,5)
L’estructura primària és la seqüència dels aminoàcids. És una seqüència...