Biólogo

Biología de Mamíferos Acuáticos Laboratorio BIOL3308-1 y 2
Profesora: Paula Satizábal Práctica 7
Tríos
Nombres:
GENÉTICA DE POBLACIONES
Semanas del 22 de Marzo al 16 de Abril , 2010
(3 Semanas y Semana de trabajo individual)Semana I
7 Artículo (Control de lectura)
Hoelzel, A.R (1998) Genetic structure of cetacean populations in sympatry, parapatry and mixed assemblages: implications for conservation policy. The Journal of Heredity, 89: 451–458.
Semana II
8 Artículo (Control de lectura)
Weber D.S, Stewart B.S, Lehman N (2004) Genetic consequences of a severe bottleneck in the Guadalupe fur seal (Arctocephalustownsendi). Journal of Heredity, 95:144–153.
Semana III
Parcial 2 teoría, NO hay control
Rosenbaum H.C, Brownell R.L Jr., Brown M.W. et al. (2000) World-wide genetic differentiation of Eubalaena: questioning the number of right whale species. Molecular Ecology, 9:1793–1802.

INTRODUCCIÓN:

Los análisis de genética poblacional del manatí amazónico (Trichechus inunguis) y el manatí del Caribe(Trichechus manatus), basados en el estudio de la región control del ADN mitocondrial o Dloop, han sugerido una fuerte estructura entre poblaciones que en su mayoría no presentan barreras físicas o geográficas evidentes (García-Rodríguez et al. 1998, Cantahede et al. 2005, Vianna et al. 2006), soportando la hipótesis de filopatría por parte de las hembras.

De esta forma se les ha adjudicado alos machos el rol de generar flujo genético entre las poblaciones de manatíes, Sin embargo en la actualidad poco se conoce sobre los movimientos realizados por los machos (Vianna et al. 2006).

En esta práctica vamos a análizar la composición genética de la región control de las poblaciones centroamericanas (México, Belice, Honduras, Nicaragua, Costa Rica y Panamá) del manatí del Caribe. Paraesto compararemos los resultados obtenidos para todos los individuos y también para las hembras y para los machos por separado, para así evidenciar si el ADN mitocondrial de los machos presentan un patrón de diversidad genética diferente al de las hembras, dando indicios de intercambio genético entre las poblaciones.

OBJETIVOS:
* Entender los conceptos básicos y los pasos que se deben seguiral empezar un estudio en genética de poblaciones.
* Realizar un análisis genético de las poblaciones centroamericanas del manatí del Caribe (Trichechus manatus) e identificar las repercusiones de los resultados obtenidos en la conservación de los manatíes centroamericanos.
METODOLOGÍA:
Semana I
Se realizará un sexaje molecular y una amplificación de la región control del ADN mitocondrial demanatíes Trichechus manatus.

Cálculos PCR:
I. Lo primero que se debe hacer para empezar un estudio de genética de poblaciones es buscar en la literatura si existen los primers y el protocolo de PCR (Master mix y tiempos del termociclador).
En este caso nos referiremos al artículo de Filogeografía de manatíes de García Rodríguez et al. 1998 (ANEXO 1) en el que utilizan la región control(Dloop).
a) Encuentre el nombre de los primers que utilizaremos e identifique su secuencia:
Primer (5`-3`) | Nombre | Secuencia |
| | |
| | |

Estos datos son los que se envían a empresas como Biodiagnóstica para mandar a hacer los primers que se utilizarán en el estudio.
b) Identifique la cantidad utilizada para la preparación del Master Mix de la Rxn de PCR:
Reactivos (MIX) |Cantidad (OJO con las unidades) |
BufferTris HClkCLGelatina | |
MgCl2 | |
dNTPs | |
Primers | |
Taq | |
ADN | |
H2O | |
Total | |

Ahora encontrará las cantidades convertidas a ul teniendo en cuenta que la solución total x muestra del Master Mix es de 24.5ul.
Dloop
Reactivos (MIX) | Cantidad Reactivo (ul)(1 muestra) | Cantidad Total (ul)(4 Muestras + Control) |
H2O |...